肝胆外科（普外科）是医院重点建设学科，依托赣州市肝病医院平台，在原发性肝癌外科及综合治疗、门静脉高压症外科、梗阻性黄疸的外科治疗、腹腔镜手术等方面具有很强的实力和优势。传统方面开展了普通外科各类常规手术，如甲状腺疾病、乳腺疾病，胃肠外科，肛肠疾病及疝外科手术治疗。微创方面开展了各类腹腔镜微创手术，如腹腔镜胆囊切除，腹腔镜阑尾切除，腹腔镜胆总管探查和“T”管引流术，腹腔镜胃癌及结肠癌根治术，成人腹腔镜疝修补术，小儿微创疝囊高位结扎等手术。尤其在原发性肝癌规范性治疗（包括传统外科肝癌根治及腹腔镜下肝癌切除方面）和肝炎后门脉高压疾病的外科治疗（腹腔镜下脾切除加断流术）等更具特色。另外小儿外科的微创小切口治疗小儿腹股沟疝及鞘膜积液也是一大靓点。科室年内施行各种手术数百例，在社会上拥有较高的知名度，肝胆专科方面逐渐取得业界的认可，2018年DGRS原发性肝癌手术量位居全省第七。综合实力的增强使科室成为市中心城区城西片普外科诊疗急救中心。今后科室将肝癌的综合治疗、微创外科、肝硬化后病人的手术治疗等方面作为重点研究和发展方向。
特色治疗肝胆外科方面：规范的肝癌，含肝癌的手术切除及综合治疗（消融及介入等）。肝炎后肝硬化门脉高压疾病的外科治疗。
微创手术：各种普外科腹腔镜手术治疗，腹腔镜胆囊切除等。
小儿腹股沟疝的手术治疗：赣南顶级小儿外科专家团队，手术快，住院时间短，费用低。
破伤风的治疗：有治疗专业团队，治疗抢救成功率高。
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