该院妇瘤科创建于1988年，现已发展成为集医疗、教学、科研于一体的赣南周边地区有名的妇科肿瘤专业学科，是以手术、化学治疗为主综合治疗各种妇科恶性肿瘤疾病的特色专科。
专科特色：1.妇科手术种类齐全，各种妇科恶性肿瘤，如宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌及外阴癌的根治术等规范性手术已达到国内先进水平。
2.市内最先开展腹主动脉旁淋巴结清扫，腹腔镜下盆腔淋巴结清扫和卵巢移位术，卵巢癌腹腔热灌注。
3.在肿瘤治疗方面采用手术、放疗和化疗有机结合的综合治疗和个体化治疗，同时开展严格的无瘤性操作，新辅助化疗、区域性化疗、化疗增敏以及后装治疗、复发肿瘤的粒子治疗等新技术，显著提高了妇科肿瘤的缓解率和生存率，减少肿瘤的复发。
4.在微创方面开展了腹腔镜下无瘤性的广泛全子宫切除、宫腔镜下粘膜下肌瘤切除术及宫腔重度粘连分解术等手术。
5.开展了对各种妇科良性肿瘤（子宫肌瘤、卵巢囊肿等疾病）与一般普通妇科疾病的诊治工作，率先开展了下乡免费义诊及妇科肿瘤的筛查；对各种性传播性疾病、阴道炎等疾病的诊治具有丰富的经验。
科研方面：高度重视、积极开展临床与临床基础研究，承担了多项科研项目，并获科技成果奖。其中对宫颈癌、卵巢癌的研究颇具特色。
教学方面：承担着赣南医学院的临床医学、护理等专业的妇科教学工作及实习生、见习生、住院医师的带教工作。
经过20余年的锤炼，妇瘤科在医疗、教学、科研方面积累了丰富的经验，学科整体水平已达国内先进水平。
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