庆元县人民医院内镜室现有专业技术人员4人，其中主治医师1人，医师3人。拥有富士能电子胃镜两台、电子肠镜一台，他们的共同特点是：管径细、柔软、图像清晰、逼真、分辨率高，被检者痛苦少等优点。实行计算机数码管理，摄像系统可通过彩色电视，直接观察胃内各种病变，送上级医院会诊或复查时参考。还可对溃疡出血患者在镜下直接药物喷洒止血；能迅速准确检测幽门螺旋杆菌（HP），胃肠道息肉切除，钳取活检组织进行病理切片化验或特殊染色，进行炎症程度、癌分化程度分级，制订治疗方案或判断治疗效果。
庆元县人民医院内镜室新型胃镜对食道炎、胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡、胃癌等疾病的检出率高，并可进行镜下止血、取异物术等；结肠镜可直接观察大肠癌肿、息肉、溃疡、糜烂、出血、色素沉着、血管曲张和扩张、充血、水肿等，用于原因不明的下消化道出血、慢性腹泻、腹部肿块、中下腹疼痛、低位肠梗阻等检查。
庆元县人民医院内镜室被列为浙江省消化病学术中心科研协作单位。
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