民航总医院于1993年开展血液透析治疗，前身是内科透析室2000年成立独立血液透析中心，目前配有国际上先进的透析机70台，同时配有血容量监测、在线尿毒清除率测定及自动血压监护等先进设备，已开展血液透析、血液滤过、血液灌流、腹水回输、连续肾脏替代治疗等多项国内外先进的血液净化治疗。目前有常规透析病人近300人，年透析42000余次，患者生存率高于全国平均水平，未发生严重医疗事故。2007年被北京市血液净化质量控制改进中心评为培训基地，2015年评为北京市护理学会血液净化专科护士培训基地，为全国各地培养了多名医护技人员。
中心现有医生16人（其中高级职称3名，中级职称7名），博士及硕士学历14人，护士36人。在中心成立的十余年中，多次参加国家重大灾难救援及支边服务工作，在2003年抗击“非典”过程中始终保持透析治疗，无一位患者及工作人员感染。2008年“汶川”发生强烈地震，我中心4名医护人员第一时间奔赴灾区，为抗震救灾做出了贡献。2012年我们响应国家号召帮扶内蒙土右旗医院开展血液透析工作，为该县建立首个透析室。多年来始终坚持“安全第一、服务至上”理念，每年举办肾友联谊会，与透析患者良好沟通。自2007年起已连续举办七届海峡两岸血液净化交流会，取得了圆满成功。民航总医院透析中心已发展成为本市东部地区最大的透析中心之一，先后被民航总局全国“三八”服务标兵和“工人先锋号”，下一步将依靠医院总体发展规划，建立北京一流透析中心。
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