传染科始建于1940年，是和平县唯一的传染性疾病重点专科，担负着全县传染病病人的定点收治及国家二级甲等综合医院的院前救治工作，对和平县传染病疫情的诊治、预防和控制起到了至关重要的作用。科室现有床位42张，医护人员17名，其中副主任医师2名，主管护师3名，执业医师4名。
传染科着重于传染病的临床治疗和传染病预防的健康宣传，业务辐射周边县区，科室建立了重症监护病房，积极引进新技术，开展新项目和科研工作，取得了可喜的成绩，率先在和平县开展“结核菌素试验”（PPD试验）、结核性胸膜炎、肝硬化腹水的微创置管治疗，与国际、国内同步的慢乙肝的抗病毒治疗、丙型肝炎的抗病毒治疗，开展了肝炎病毒的各项血清学检测及免疫功能的检测，为诊断和治疗提供了有力的保障。
近年来和平县人民医院注重传染科的重点打造和发展，单独建设一栋传染楼，建筑面积达4653平方米，其中一楼为发热门诊、肠道门诊及肝病门诊，二楼为普通病房，三楼为严密隔离区。投入大量资金引进先进技术和设备，常年开展肺结核、慢性乙型肝炎、丙型肝炎、肝硬化、流行性腮腺炎、水痘、细菌性痢疾、手足口病、恙虫病等传染性疾病的诊治。
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