苏北人民医院胸心外科1956年建科，是江苏省临床重点专科、扬州市重点学科和临床重点专科，扬州市胸心血管外科学会主任委员单位，分为普胸外科和心胸外科两个亚专业。拥有教授、主任医师3人，副主任医师4人，主治医师3人，住院医师6人。其中博士7人，硕士8人。江苏省“135”和“科教兴卫工程”医学重点人才2人，江苏省“青蓝工程”中青年学术带头人1人，江苏省“333”工程培养对象1人，扬州市“科教兴卫工程”医学重点人才1人，博、硕士研究生导师4人，每年培养研究生4-6名。四人分别曾在美国华盛顿大学附属医院、加拿大多伦多大学医院、德国奥尔登堡心脏中心、日本顺天堂大学医学部附属顺天堂医院研修。科室拥有床位56张，年收治病人2000余例次，年手术近1000台。
普胸外科专业自建科以来，扎实开展临床工作，不断提高对各种危重疑难疾病的诊断和外科治疗水平。常规开展各种食管癌和贲门癌根治性手术，包括多径路食管癌和贲门癌切除，结肠代食管术，全胃切除Rou-en-Y食管空肠吻合术。自1990年率先在省内开展“颈、胸、腹”三切口食管癌根治术，已成功治疗4000余例病人，手术切除率、术后生存率居国内领先水平，手术死亡率和并发症发生率均较低，并形成专科特色，在省内享有一定的知名度;常规开展多种术式治疗肺癌，包括肺叶切除术，全肺切除术，余肺切除术，心包内处理肺血管的肺叶和全肺切除术，支气管和肺动脉袖式切除重建术等;另外常规开展胸壁、胸腔、纵隔肿瘤切除术，胸壁畸形矫治术，食管良性肿瘤切除术，食管憩室切除术，贲门失驰缓症贲门肌层切开术，胸膜纤维板剥脱术，胸廓改形术，脓胸引流术，膈疝修补术等。在胸部外伤重症急救等方面也取得了显著的成绩。
积极开展新技术和新项目，近年来在微创外科方面取得了长足的进步，成绩喜人，如全胸腔镜下肺叶切除术，胸腔镜下食管良恶性肿瘤切除术、肺和胸膜活检术、胸膜固定术、纵隔肿瘤切除术、交感神经切断治疗手汗症、NUSS手术漏斗胸矫正等。特别值得一提的是，近年来该院胸外科开展了纵隔镜淋巴结活检术，经颈小切口胸腺切除术等新技术，均填补了省内空白。
心脏外科专业近年来手术量逐年递增。配备有全套进口中心监护系统，包括固定式监护仪，便携式监护仪，中心监护站，各类呼吸机，血气分析仪、主动脉内球囊反搏仪、床边X线机、心脏彩超机、心脏起搏器、血滤等检查治疗设备。率先在苏北地区独立开展先心病矫治、瓣膜病瓣膜置换和成形术、冠心病停跳和不停跳冠状动脉搭桥术、主动脉夹层动脉瘤以及主动脉瘤的开放手术以及腔内隔绝手术。目前手术病种涵盖各类危重、复杂心脏疾病，近年开展了多项新技术新业务，在主动脉夹层全弓置换术、主动脉弓部三分叉血管和支架的应用、房颤射频消融术、右胸小切口心脏手术、食道超声引导下经胸微创房室缺封堵术等方面取得了突破性进展。
历年来承担扬州大学医学院、湘雅医学院等院校博士和硕士研究生教学，扬州大学医学院本科生和留学生的教学工作，教学质量领先。先后主办和协办了国家级、省级和市级继续教育项目和大型学术活动。科室拥有多项国家级和省级课题，已获得国家自然科学基金资助3项，省、市级课题12项，组织工程人工气管、生物瓣膜抗钙化等实验研究走在全国前列，填补省内空白。在省级以上杂志上发表论文超过150篇，其中SCI收录论文30篇，中华系列期刊发表论文40余篇。与美国、加拿大、德国、荷兰、以色列、瑞士、日本等国家多个心脏中心保持友好往来。
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