CT室成立于2013年，拥有一支技术过硬、经验丰富、服务质量一流的团队，锡盟蒙医医院CT室是全院影像远程会诊中心,也是锡林郭勒盟新成立的卒中中心影像诊断机构，担负着远程会诊任务及门诊急诊及卒中诊断工作;服务范围CT室开展项目有头颅、五官、颈部、胸部、腹部、盆腔、脊柱、四肢等器官的螺旋CT检查，开展新项目有无创伤血管成像技术（冠脉，主动脉，肺动脉，双上下肢血管，头颈部血管），冠心病早期筛查、五官部位HRCT扫描，2维及3维重建技术、器官二联检查、胸痛三联检查、仿真内窥镜、各种组织及器官灌注成像等。近几年开展了CT引导下各种部位及组织穿刺活检诊断术，肝脏、肾脏囊肿、肝包虫治疗术，对于确定疾病性质及选择合理治疗方案起到极其重要作用，目前开展新项目有CT引导下微粒子植入治疗恶性肿瘤等。
医疗设备：目前引进的的64排128层飞利浦容积CT是目前内蒙古自治区比较先进的影像设备。该设备扫描速度极快，拥有更高的图像质量和分辨率，更强大的后处理工作站，更广泛的临床应用领域，更低的放射剂量。对肺癌的筛查和肺弥漫性病变的诊断有重要价值。在高速螺旋扫描的同时得到高质量图像，对微小病变分辨率极高，使肿瘤的早期发现成为现实。而且各种软件先进、功能强大、可开展项目大大增加，如对冠心病的早期筛查，检查方法简单，病人无创伤，辐射量小，费用只是冠状动脉造影的1/5，成为冠心病早期诊断的首选方法。2017年引进128排GECT设备，将会更加提高CT室综合实力。
锡盟蒙医医院CT室开创了锡盟地区首个影像远程会诊平台，与北京各大医院开展了远程影像会诊业务，使患者足不出户就能享受到北京、内蒙知名专家的准确诊断。赢得了较高的社会声誉和良好的社会影响，在影像诊断方面积累了丰富的诊断经验。
CT室是集临床、教学为一体的综合性科室，现有医护人员10人，其中副主任医师1名、主治医师及医师共7人、副主任护师1人，其中硕士1名，研究生结业1人；在脑血管病、心血管疾病、各系统肿瘤、牧区常见疾病诊断方面形成自己的特色。本科常年承担基层医生实习、规培及进修的带教任务。年平均接诊已逾2万余人次，介入治疗病人30余人次。经统计，CT、MRI检查阳性率平均达百分之七十以上。诊断符合率平均达百分之九十以上。
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