北京大学人民医院耳鼻喉科成立于解放前，1942年，由林必锦教授主持科内工作，并聘请我国耳鼻喉科鼻祖刘瑞华教授为顾问。1943年，刘瑞华教授全面主持科内工作。1953年，时任主治医师的刘芳柽负责我科的医教研全面工作。1960年耳鼻喉科从外科中分离，成为独立的耳鼻喉咽喉科和耳鼻咽喉教研室。1995年，划分为三个专业组：耳科组，鼻科组，以及咽喉头颈组并延续至今。1999年，耳鼻喉科博士研究生的申报顺利通过，时任科主任的于德林教授也成为了北京大学医学部的首位耳鼻喉科博士生导师。2001年，余力生教授接任耳鼻喉科主任至今。
耳鼻喉科分为耳、鼻、咽喉头颈三个专业组：
耳科专业组内包括3名主任医师，3名副主任医师，带领1-2名主治医师，组建了耳内科学组及耳外科学组，每年完成中耳、内耳各种显微手术500余例，能够开展听神经瘤、颈静脉球体瘤等侧颅底肿瘤切除等疑难手术，眩晕的外科治疗水平位于国内领先水平。于国内首先报道了中耳内窥镜的临床应用研究，填补了国内这方面的空白。自2000年起开展了人工耳蜗植入手术，是国内最早开展这项技术的单位之一，并于2002年完成了国内首例双侧人工耳蜗植入。2005年成为北京市首批5家免费人工耳蜗植入基地。耳内科每年收治耳聋、耳鸣、眩晕等病例百余例，提出了突发性耳聋的分型治疗方案，取得了很好疗效。每年开设的耳外科及耳内科学习班在业内口碑极佳，受益者众。2007年，由北京大学人民医院耳鼻喉科发起的全国多中心突发性耳聋临床研究正式启动，这是国内耳鼻咽喉头颈外科学界首次进行的大规模临床多中心研究。2015年，余力生教授作为第一执笔人制订了中国突发性耳聋诊疗指南，并于次年作为主要参与者，修订了中国梅尼埃病及BPPV的新诊疗指南。耳科诊疗进展学习班，开办于2009年，在业内同样广受好评，影响深远。
鼻科专业组内有高级职称3人，主治医师2人，每年完成鼻内镜微创外科手术500余例。1989年，在于德林教授的领导下，于国内率先开展了鼻内窥镜手术技术，并一直居于国内领先水平，至今开展手术数千例，取得了良好疗效。自1994年开始每年举办一期全国鼻内窥镜学习班，至今已经成功地举办了20余期，为我国鼻内镜技术的发展做出了巨大贡献。在国内率先开展了经鼻的鼻腔泪囊造口术，双径路上颌窦手术，并首创了鼻甲粘膜下组织切除术，并在国内获得广泛应用。目前能够开展包括侧颅底、前颅底手术，鼻眼相关手术，鼻面部创伤修复术等疑难复杂手术。
咽喉组由2名主任医师，1名主治医师组成，头颈咽喉组除了在呼吸睡眠暂停综合症的诊断、治疗中保持特色外，还开展了各种类型的头颈部肿瘤切除术，颌面部手术，并进行术后功能重建以及嗓音的手术治疗。每年完成的咽喉手术例数位于北京市各级综合性医院的前列。咽喉头颈学组带头人张立红教授，在胃食管反流的临床及基础研究中有较深造诣，参加中华咽喉反流指南制定。
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