巴彦淖尔市中医医院血液科是该市成立最早的血液疾病专科，凭借中西医结合的精湛技术、医患之间的良好沟通及患者康复后的认可，近年科室快速发展，目前已形成了先进的血液学诊断和中西医结合的综合治疗体系。2012年被国家中医药管理局选定为“十二五”重点培育专科，2015年被授予中国民族医药学会理事单位，学科带头人焦银萍当选为中国民族医药学会血液病分会常务理事。《中西医结合治疗白血病》、《大剂量阿糖胞苷治疗急性白血病》等多项科研课题获科技局奖励。中医院血液科为巴市地区儿童白血病定点救治医院，享受全额报销的优惠政策。
科室开放床位56张，医护人员18人，科室每年都有人员赴天津血液病医院、北京301医院、北京大学人民医院、北京西苑医院、北京中医院等地进修学习，及时掌握国内中西医治疗血液病的最新进展，同时科室与上述医院长期建立协作关系，可方便患者的转诊。科室派出专人赴北京协和医院学习深静脉穿刺术，能进行各种肿瘤、白血病及长期静脉输液患者的深静脉置管及护理技术，极大地减轻了病人的痛苦。科室配有层流洁净病房、病室空气洁净屏、德国进口血细胞分离机进行血细胞单采术及血浆置换术。科室拥有先进的骨髓细胞学检测系统进行骨髓涂片细胞形态学和组织化学染色检测。同时科室与全国最先进的检验中心协作，能开展流式细胞免疫分型、融合基因、细胞遗传学分析、染色体荧光原位杂交、实时定量PCR、白血病残留微小病灶检测、各种血药浓度测定以及骨髓移植配型等，使患者在当地就能享受到最先进的诊断方法，缩短了患者的诊断时间，减轻了经济负担。
科室在过敏性紫癜、免疫性血小板减少性紫癜、急慢性白血病、恶性淋巴瘤、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征、多发性骨髓瘤、骨髓增殖性肿瘤、溶血性贫血等各类贫血以及系统性红斑狼疮等疾病的治疗上采用中西医结合，形成了该科独有特色。
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