赣州市妇幼保健院小儿外科是赣州市唯一专业从事小儿外科医疗中心。是广州市儿童医院及江西省儿童医院协作医院。现有主任医师1名，副主任医师2名，主治及住院医师5名，并具有一批专业素质高、业务能力强的护理队伍。我科医护人员大多曾在北京、武汉、广州、南昌等大型专科医院进修学习。我院小儿外科已建设成为涵盖新生儿外科、小儿普通外科、小儿泌尿外科、小儿骨科等专业的综合性科室，现为我院重点建设科室。
小儿外科常规开展小儿各种急腹症，体表、颈部及腹部肿瘤，胃、小肠、肝胆、结肠、直肠、肛门、泌尿系统等疾患手术。如小儿急腹症、消化道梗阻、消化道出血、消化道穿孔、腹部肿瘤、腹部外伤、先天性消化道畸形（如脐膨出、腹裂、先天性胸腹裂孔疝、幽门肥厚、肠重复畸形、麦克尔憩室、先天性肠闭锁、先天性巨结肠、先天性肛门直肠畸形）、后天性肛前瘘、肛门狭窄、胆道结石、胆总管囊肿及泌尿系先天性畸形：先天性肾积水、重复肾重复输尿管、肾发育不良、尿道下裂、隐匿性阴茎等手术。
特色治疗:1、开展了微创经肛门改良Soave巨结肠根治术治疗婴幼儿先天性巨结肠手术。该技术的引进及运用填补我市空白，达到省内领先水平。
2、率先在赣州市开展了小儿急性肠套叠在B超监视下水压灌肠复位术，该技术复位成功率高，避免了小儿的开腹手术，创伤小，疗效安全可靠，费用低。
3、小儿腹股沟斜疝及鞘膜积液采用腹部皮纹小切口、微创、住院时间短，术后无明显的手术疤痕。
4、体表部分的血管瘤及巨大的淋巴管瘤，采用的药物注射及手术综合治疗，术后疗效良好。
6、开展了先天性尿道下裂一期尿道成形术。其中尿道支架“管中管”的运用，有效的降低了手术后尿瘘的发生率。
7、开展小儿腹腔镜手术：微创治疗小儿高位隐睾、小儿斜疝、先天性肥厚性幽门狭窄、麦克尔憩室、急性阑尾炎等。
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