甲状腺、乳腺外科系扬州市级临床重点专科普外科的亚临床专科。该科开放床位30余张，拥有一支专科知识丰富、技术娴熟、服务一流的医疗队伍，形成一个完善的治疗体系，能为甲状腺、乳腺疾病患者提供更专业、更规范的治疗，并与病理科、肿瘤内科、放疗科、内分泌科、医学影像科、核医学科等多个科室组成多学科诊疗中心，可以针对不同的患者尤其是恶性肿瘤患者制定更完善的诊疗方案。
该科主要治疗的疾病有：甲状腺及乳腺良恶性肿瘤、颈部包块、甲状腺炎、乳腺炎、乳腺增生症等。医院普外科历史悠久，普外科成立伊始已常规开展甲状腺及乳腺常规手术，目前已开展甲状腺、乳腺各类手术，包括甲状腺次全切除术、甲状腺腺叶切除术、甲状腺全部切除术、甲状腺癌根治术，乳腺良性肿瘤切除术、乳腺癌根治术、早期乳腺癌的保乳手术以及前哨淋巴结切除活检替代腋窝淋巴结清扫术
等。科室拥有甲状腺、乳腺良性结节射频消融治疗仪，部分良性甲状腺及乳腺结节可避免手术痛苦。
该科为复旦大学附属肿瘤医院甲状腺、乳腺扬州分中心，成立了复旦大学附属肿瘤医院头颈外科李端树教授工作室、乳腺科吴灵教授工作室。两位教授定期来医院坐诊、查房、手术，患者不出远门就可
以得到上海知名专家面对面的诊治，享受到国内一流医疗水平的服务，尤其是疑难疾病可以得到更权威的治疗方案。该科全体医护人员本着质量第一、服务至上的理念，以精湛的医疗技术、热情的服务态度、优美的医疗环境为广大病员提供优质满意的服务。
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