该院普通外科是江苏省临床重点专科、扬州市临床重点学科。目前分四个病区，即207病区、208病区、209病区、309病区，共265张床位，共五个分科，包括胃肠外科、肝胆外科、疝及儿外科、甲乳外科及血管外科。现有各级医师46人，教授2人，副教授6人，省333工程培养对象5人，国家卫计委突出贡献的中青年专家1人、省有突出贡献中青年专家1人，市有突出贡献中青年专家2人，其中正高职称9人，副高级职称9人，中级职称12人，博士生导师1人、硕士生导师8人，博士后2人，博士(含在职在读)10人。普通外科人才结构合理，理论、实践能力强，无论医疗、科研、教学，在扬州市都处于领先地位。
近10年来，获国家自然科学基金两项，获省、厅、市级科研进步奖30余项，省级以上杂志发表学术论文100余篇，其中SCI收录10余篇，主编专著近10部，参编医学英文专著1部。每年承办国家级及省级继续教育学习班。
该科是中南大学湘雅医学院和扬州大学医学院硕士学位授予点，也是国家级博士后工作站。长期承担扬州大学医学院普通外科教学任务，南京医科大学、南京东南大学医学院、南京海医大实习生的实习常教工作。该科还是全国首批腹腔镜技术培训基地，住院医师、全科医师规范化培训基地，留学生培养基地。并每年为乡镇医院培养一批医疗技术骨干。
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