该院病理科位于急诊三楼，面积约450平方米。独立设置，是该院唯一接收病理标本的科室，负责该院门诊、病房所有病理标本的收集、检查等工作，做到了集中设置、统一管理。
病理科始建于1976年，是全县所有医院中最早成立的病理科。现有诊断医师6名，技术员3名。其中本科7人，硕士1人；主任医师1人、主治医师2人、住院医师3人，主管技师1人，形成了良好的人才梯队。
科室设立取材室、制片室、诊断室、办公室、档案室、储藏室等，现有设备：徕卡冰冻切片机一台、徕卡石蜡切片机一台、奥林巴斯显微镜7台、包埋机及漂烘仪各一台、自动脱水机2台，HPV分型设备一套，肿瘤细胞DNA定量分析系统及染色制片设备一套。科室每年常规石蜡切片诊断9000例左右，细胞学诊断6000例左右，免疫组化300例左右，术中冰冻切片诊断800例左右。诊断水平全县领先，各项诊断符合率在96%以上，长期承担县内疑难病理诊断。
病理科的常规工作包括活体组织检查和细胞学检查两大部分。除日常工作外，该科在县内率先开展了免疫组化检查、术中快速冰冻切片诊断、膜式病变细胞学检查，近两年开展了人乳头瘤病毒28型分型检测及肿瘤细胞脱氧核糖核酸定量分析检查。免疫组化的开展对肿瘤鉴别诊断及恶性肿瘤治疗的有效性具有重要的实际意义；液基薄层细胞学检测、人乳头瘤病毒28型分型检测及肿瘤细胞脱氧核糖核酸定量分析检查，显著提高了宫颈癌前病变及宫颈癌的检出率；术中快速冰冻切片及诊断的开展，大大缩短了手术医师术中等待报告时间，所有报告均在30分钟以内完成。
多年来，科室以其严格的科学管理、高质量的内涵服务和高水平的诊断技术赢得了患者和临床医生的信任，在县内病理界以及医院中享有较好的声誉，现为泗阳县临床重点专科，宿迁市医学会病理学分会副主委单位，江苏省人民医院病理科专科联盟单位。近5年在病理学核心期刊发表论文6篇，获得宿迁市科技进步三等奖一项。
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