南通大学附属医院病理科建立于1964年，集医疗、教育、科研于一体，主要承担院内每年30000余例的病理诊断、3000例左右的术中快速诊断和1000例左右的外院会诊，兼顾南通大学肿瘤学专业、病理学专业及其他临床专业研究生的带教任务，同时承担地区其他医院病理医师的进修学习，是苏中、苏北地区病理学专业的领头羊。
病理科下设临床病理诊断室、病理技术室、细胞学诊断室、免疫组织化学室、分子病理室、肿瘤药敏室，建筑面积达600多平方米。科室拥有德国进口的冰冻切片机2台、石蜡切片机6台，全自动脱水机2台，细胞学液基处理仪1台，全自动免疫组化染色机1台，全进口细胞培养设备及板式自发光检测系统1套，病理学图文处理系统2套，进口光学显微镜18台。另外，科室实时更新并拥有完备的最新病理专业书籍和国际医学专业期刊，确保科室病理知识的及时更新和业务水平的稳定发展。
病理科目前共有医务人员共20名，医师10名，技师8名。其中主任医师2名，副主任医师3名，主治医师4名，副主任技师2名，主管技师3名。博士研究生1名，在读博士研究生1名，硕士研究生3名，在职硕士研究生4名。其中有硕士生导师2名。
近年来，科室工作人员主持并参加国家级、省市级科研项目近10项，且获得省市各级科技进步奖近20项，参编病理教材及病理专著共3部；近3年科室共发表SCI文章近20篇，国家级和省级以上刊物上发表文章20余篇。科室每年带教临床各专业的研究生10余名，指导他们设计和完成课题，帮助他们提高病理知识和病理诊断水平。
科室积极参与国际国内的学术交流和合作，不定期派出病理学医师赴美国、日本等国进行访问交流学习，每年参加国际国内的专业学术活动20余人次，并在会上积极发言，有力地提升了科室病理诊断水平，提高了在全国和省市内的知名度。
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