海宁市妇幼保健院儿童保健科是海宁市儿童保健工作的业务指导中心，承担着全市儿童保健工作的技术指导、业务培训及监督管理等工作。儿童保健是专业公共卫生服务机构，科室配备先进仪器设备包括美国及丹麦进口儿童听力及视力筛查仪、儿童骨密度超声检测仪、儿童神经心理评估工具、营养评估软件等。目前共有医护人员13人，其中副主任医师2名、主治医师5名、康复师1名。2018年通过三乙技术学科评审，科室针对全市不同时期儿童，积极开展儿童健康体检、生长发育监测与评估、高危儿管理、儿童口腔、儿童听力及视力保健、儿童营养和心理、新生儿疾病筛查、儿童早期发展指导、早期干预、儿童康复以及健康教育等多层次、全方位及专业系统的卫生保健服务。近年来，在科研方面取得了一定的成绩，海宁市金桥项目“窝沟封闭应用于学龄前儿童防龋效果观察”、重点课题“海宁市学龄前儿童视力筛查结果分析”、“海宁市出生缺陷监测”、“0-2岁儿童先天性心脏病监测”及“氟化泡沫涂布对儿童龋齿防治效果研究”等科研项目顺利结题。2010年获得“浙江省先进育儿健康教育基地”称号，2017年成为“浙江省儿童早期发展示范基地”，2018年获得“浙江省新生儿遗传代谢性疾病筛查质量优胜奖”，2019年荣获中国妇幼保健协会授牌为“儿童眼保健示范单位”。
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