计划生育科作为厦门市妇幼保健院一个独立科室，技术力量较雄厚，医生全部为中级职称以上，其中主任医师1名，副主任医师3名。
主要开展业务为：婚前检查，孕前优生检查，早孕期保健、检查；避孕及安全流产等生殖健康知识咨询；主要开展手术为：静脉麻醉无痛人流、B超监测下高危人流及困难取环、药物流产、子宫输卵管通液、子宫输卵管碘油造影等。
其中无痛人流及药物流产为厦门市最早开展的医院之一，技术成熟，有一套完整的有关无痛人流及药物流产的适应症禁忌症术前术时注意事项及术后多钱观察诊治规范。自开展以来未发生麻醉及点评手术意外，药物流产完全流产率达90％以上，深受广大育龄妇女欢迎开展的笑气镇痛麻醉使更多妇女在计划生育手术丰富时免除身心多啦痛苦
科室引进第二、第三代短效口服避孕药及新型宫内节育系统为广大育龄妇女的避孕提供更多更好的选择。
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