肛周脓肿通常不建议自行使用药膏，因为其本质是感染形成的脓腔，药膏难以穿透皮肤到达病灶。治疗肛周脓肿，首先需要明确其严重程度，临床上一般针对伴随的局部症状（如红肿、疼痛）使用消炎止痛的药膏，但仍需以手术切开引流为核心治疗手段。可用于辅助缓解症状的药膏包括鱼石脂软膏、夫西地酸乳膏、百多邦莫匹罗星软膏、红霉素软膏以及复方角菜酸酯乳膏。
1、鱼石脂软膏
鱼石脂软膏具有消炎、消肿的作用。当肛周脓肿处于早期，炎症尚未形成明显的波动感（即局部皮肤未变软、摸不到液体感）时，使用该药膏可以帮助减轻局部红肿。但需要注意，一旦脓肿成熟，使用该药膏无法替代切开引流，患者应及时就医处理。
2、夫西地酸乳膏
夫西地酸乳膏是一种皮肤外用抗生素，主要针对由金黄色葡萄球菌等细菌引起的感染。对于肛周脓肿合并周围毛囊炎、疖肿或表皮破损的情况，涂抹此药膏有助于控制局部浅表细菌，减轻继发的感染。如果脓腔已经形成，不能单靠此药膏治疗。
3、莫匹罗星软膏
莫匹罗星软膏常用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染。在肛周脓肿早期，局部皮肤没有破溃但有红、肿、热、痛时，可以使用它来抑制细菌，防止感染范围进一步扩大。当脓肿自行破溃或切开引流后，医生也可能建议在伤口周围涂抹此药膏预防感染。
4、红霉素软膏
红霉素软膏是一种大环内酯类抗生素，对于肛周浅表皮肤的细菌感染有一定效果。如果肛周脓肿伴随周围皮肤出现小的红疙瘩或轻微糜烂，适当涂抹能起到预防感染扩散的作用。不过红霉素对大多数形成脓腔的深部细菌效果有限，不宜作为治疗脓肿的主力药物。
5、复方角菜酸酯乳膏
复方角菜酸酯乳膏主要用于缓解肛门部位的疼痛、瘙痒和水肿。当肛周脓肿伴有明显的疼痛不适，但又未达到立即手术的程度时，使用该药膏可以暂时减轻局部不适感。它属于对症缓解用药，不能杀灭引起脓肿的致病菌，只能作为辅助手段。
肛周脓肿一旦确诊，常用药膏往往只能起到暂时缓解症状或预防浅表感染的作用，无法根除深部的脓腔。患者应尽快前往医院肛肠科就诊，医生通常会根据情况安排手术切开引流。术后需要每天更换敷料，保持肛周清洁干燥，排便后用温水清洗，避免长时间坐着或用力排便，饮食上多吃富含膳食纤维的食物如红薯、芹菜、全麦面包，多喝水，防止便秘，以免脓腔反复发作或形成肛瘘。
