止痛药的副作用通常不大，多数人在规范使用下耐受良好，但过量或长期服用可能引发胃肠不适、肝肾损伤等风险。
生理性反应是止痛药最常见的轻微副作用表现，部分人群服药后可能出现短暂的恶心、胃部灼热感或轻度头晕，这通常与药物对胃肠黏膜的直接刺激或中枢神经的暂时调节有关，一般无须特殊处理，停药或随餐服用后可自行缓解。药物引起的胃肠道损伤是较为普遍的病理性因素，非甾体抗炎药可能抑制保护胃黏膜的前列腺素合成，导致胃炎甚至胃溃疡，患者常表现为持续性胃痛、反酸或黑便，需警惕消化道出血风险。肝脏代谢负担增加也是潜在的健康隐患，某些止痛成分需经肝脏酶系转化，长期大剂量使用可能导致转氨酶升高或药物性肝炎，伴随乏力、食欲减退及尿色加深等症状。肾脏功能受损多见于脱水状态下的用药行为，药物可能减少肾脏血流灌注，诱发急性肾小管坏死或间质性肾炎，临床可见水肿、少尿或血肌酐异常升高。过敏反应虽发生率较低但后果严重，特异体质者接触阿司匹林或布洛芬等成分后可能诱发皮疹、喉头水肿甚至过敏性休克，需立即停药并紧急救治。
日常使用中应严格遵循医嘱控制剂量与疗程，避免空腹服药以减轻胃肠刺激，服药期间注意观察身体反应，若出现持续腹痛、皮肤黄染或排尿异常应及时就诊，同时保持充足水分摄入以促进药物代谢，切勿自行叠加多种止痛药物以免增加毒性风险，有基础疾病者用药前务必咨询专业医师评估安全性。
