解放军总医院泌尿外科创建于1959年，改革重组后，解放军总医院泌尿外科医学部于2020年6月28日正式挂牌成立，由第一医学中心(解放军总医院本部)、第三医学中心(原武警总医院)，第四医学中心(原解放军第304医院)，第五医学中心(原解放军第307医院)，第六医学中心(原海军总医院)，第七医学中心(原陆军总医院)，第八医学中心(原解放军第309医院)七个中心组成。经过60多年的奋力拼搏，医学部现已发展成全军和全国领先、国际一流的泌尿外科中心，2020年全国医院专科排行榜位居全国第2位。泌尿外科医学部现有高职专家36名，专业技术人员106人。是集临床、教学和科研于一体，设备齐全、技术力量雄厚、专业人才结构合理。现有国家杰出青年基金获得者1人、中国青年科技奖1人、求是杰出青年奖1人。学部培养了数千余名国内外泌尿外科专科医师，他们很多都成为世界各地医院泌尿外科学科带头人包括欧洲知名大学泌尿外科主任。医学部设结石外科、肾脏外科、膀胱外科、前列腺外科、肾上腺外科和男科6个亚专科和专业组和1个研究所。年门诊量超过33万人次，年手术量超过10000例。先后承担国家863项目、国家“十一五”计划科技支撑项目等国家级、省部(军队)级重点课题40余项。团队先后获国家科技进步二等奖2项、何梁何利科学与技术进步奖1项、中华医学奖一等奖4项、军队及省部级奖项30余项。
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