病理科成立于上世纪50年代末期，于本市市级医院中最早成立。现为非常重要的临床病理学科，担负着医院的临床病理诊断、科研和教学任务以及院外病理会诊工作。目前是成都市病理质量控制中心、国家级和四川省住院医师规范化培训基地，成都市医保局确定的九个成都市重特大疾病医保认定和治疗机构之一。病理科医疗设备齐全，技术力量雄厚，诊断经验丰富，病理诊断水平居全市领先水平。科室现有人员18人，诊断医师9人，硕士研究生8人，在市级医院中名列前茅。诊断组主任医师1人，副主任医师1人，主治医师4人，住院医师3人；技术组6人，本科4人，中专2人；资料组3人。
病理科严格按照国家卫计委“三甲”医院标准建设，开展检查项目包括活体组织检查、手术大标本的组织病理检查、液基细胞学及常规细胞学（细胞块）检查、细胞DNA倍体检测、术中冰冻切片检查、快速石蜡诊断、免疫组织化学染色、特殊染色、原位杂交、HPVE6/E7检测、细胞DNA倍体分析、肿瘤分子病理基因检测等。诊断病例每年达2万余例，细胞学诊断达4余万例。在宫颈病变的联合筛查应用方面较为成熟，尤其在皮肤病理诊断方面在省内处于领先水平。
作为成都市病理质控中心，担负着全市基层医院病理人员的全面质控培训工作，已经成功举办了四届成都市病理质控培训班。
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