核医学是应用放射性核素进行疾病诊断与治疗的一门学科，是核物理、电子工程学、化学、分子生物学和计算机技术与医学相结合的新兴学科。核医学科成立于1982年，经过20年的不断发展，成为具有相当规模，在广东省及全国有一定影响的科室，是广东省重点扶持学科之一，广州市教委重点实验室。
广医二院核医学科现有实验室面积800平方米，1985年引进华南地区第一台SPECT，1991年引进华南地区第一台双X线能量骨密度仪，使核医学临床工作进入了高速发展阶段。
广医二院核医学科现有双探头SPECT两台，其中一台为双探头SPECT带CT定位符合线路功能显像仪，一台双X线能量骨密度仪，多功能仪一台，化学发光仪4台，自动免疫测量仪2台，还有其它实验室设备和电脑等，固定资产约合人民币1200万元。
广医二院核医学科现有专业技术人员15人，其中正高1人，副高4人，中级3人，硕士研究生学历2人，博士1人。目前开展脏器显像，正电子显像，功能检查，放射性核素治疗（包括甲亢，皮肤血管瘤，恶性肿瘤骨转移，颅咽管瘤等），体外检测（包括多种体内激素，肿瘤标志物，药物浓度，肝炎病毒等），每年检查10万人次，满足临床诊断的要求，促进医疗水平不断提高，取得较好社会效益和经济效益。
广医二院核医学科在教学方面，1993年成立了临床核医学教研室，实验核医学教研室，承担了广州医学院医疗本科《临床核医学》，影象本科，专科《影象核医学》，检验本科《检验核医学》，硕士研究生《实验核医学》等课程，年教学时数200学时，学生人数达400人。参与20所院校协编教材《核医学》，多媒体教学软件设计获广东省高教厅科研立项，并获广东省高教厅多媒体设计二等奖。
广医二院核医学科在科研方面，获得广东省卫生厅，科技局重点攻关立项，承担国家九五攻关课题协作组成员。成果方面：《小儿股骨头无菌性坏死的机理研究》1993年获国家教委科技进步一等奖（第二获奖者），《骨动态显像在股骨头缺血性坏死疾病的血流动力学研究》和《肝胆动态在胆汁流体动力学研究》分别获得1994年广州市科技进步三等奖。
广医二院核医学科目前可以进行核素心肌灌注，心肌正电子显像，门电路心血池显像，脑血流灌注，肺通气灌注显像，甲状腺，全身骨，肾动态，唾液腺显像，正电子亲肿瘤显像等。还可以进行肾功能，双能X线骨密度测定等。
广医二院核医学科能够开展常规核医学治疗：包括甲亢，皮肤血管瘤，疤痕，骨转移癌，骨质疏松，类凤湿关节炎云克治疗。放免检测项目已开展甲状腺激素，甲状旁腺激素，性激素，肿瘤标志物，药物浓度，糖尿病相关激素，心血管，血液，骨代谢，肝炎，肾功能等几十种体外检测。
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