石河子大学医学院第一附属医院病理科成立于1950年，是新疆唯一集临床、科研、教学一体的病理科，科室已发展为疆内病理诊断水平高、技术最全面的临床病理诊断中心之一。病理科先后入选卫生部国家级临床重点专科，国家双语示范课程，石河子大学医学院首批硕士学位授予点和临床病理学专业硕士学位授予点，是新疆兵团病理质量控制中心、远程会诊中心、自治区及兵团重点学科，全国及兵团“两癌”筛查培训基地，病理住院医师和国家病理规范化医师培训基地。
病理科技术力量雄厚，学科队伍结构良好，现有病理工作人员41人，主任医师/教授10人，副主任医师/副教授8人；具有博士学位11人，博士后1人，7名医师有海外知名大学留学经历。博士生导师4人，硕士生导师11人。享受国务院政府津贴专家2人，兵团特聘专家1人，绿洲学者1人，兵团英才计划人选4人，9人入选全国病理专业委员会委员。
科室拥有先进的病理技术平台，建立了兵团远程病理会诊平台；作为新疆兵团的分子病理检测中心，在疆内率先开展了各项分子诊断与治疗靶标检测技术，开展了原位杂交技术，FISH技术，一步法RT-PCR技术、ARMS技术和高通量测序技术（NGS）等检测非小细胞肺癌、结直肠癌、胶质瘤、淋巴瘤、软组织肉瘤、乳腺癌等基因的改变，为临床提供了精准的分子病理诊断。开展了美国FDA和中国NMPA认证的PD-L1免疫治疗的伴随诊断，多项免疫组化检测获得到了国家卫计委病理质控评价中心（PQCC）的认证，分子诊断技术获得欧盟（EMQN）认证。
专业结构：包括淋巴造血病理、骨与软组织病理、乳腺病理（含皮肤）、肺与胸膜、胸腺及心脏病理、消化系统病理、泌尿及男性生殖系统、头颈部含中枢神经系统病理、妇科病理、分子病理、细胞病理、免疫组化与特殊染色等12个亚临床病理专科组。
专业优势及特色技术：建立了形态-免疫组化-分子病理综合诊断平台：病理科致力于提高疑难病理综合诊断水平规范工作流程，提升临床病理重点专科的临床病理工作质量，诊断水平达到疆内领先，整体水平达到国内先进行列，成为新疆的病理诊断中心之一。目前已开展的病理技术包括：原位杂交技术检测HPV、EBV；荧光原位杂交（FISH）技术检测乳腺癌HER-2扩增；一步法RT-PCR技术检测软组织肉瘤融合基因；杂交捕获二代（HC2）检测HPV-DNA；ARMS方法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变和结直肠癌K-ras基因突变；淋巴瘤基因重排检测；肾脏穿刺病理诊断、抗核抗体检测（ANA）等。
建立和完善亚专科病理诊断：适应肿瘤病理诊断学的发展和肿瘤多学科综合治疗规范的需求，建立了淋巴造血病理、骨与软组织病理、乳腺病理（含皮肤）、肺与胸膜、胸腺及心脏病理、消化系统病理、泌尿及男性生殖系统、头颈部含中枢神经系统病理、妇科病理、细胞病理、分子病理、免疫组化与特殊染色等12个亚临床病理专科组；规范工作流程，加强了临床和病理之间的联系，与临床定期开展MDT讨论，促进该学科在整体水平上的提高和学科的梯队人才建设。
建立新疆区域性数字病理远程会诊网络：发挥国家临床重点专科建设的示范和辐射作用，促进新疆和兵团临床病理工作的整体发展，有效促进医疗资源合理分布，优化资源配置，转变广大患者的就诊模式，真正实施分级诊疗制度，极大改善广泛存在的基层医疗病理学科发展薄弱的现状，切实支撑各级医疗机构病理及临床应用科室的长远发展，体系化地构建跨地域病理学科医联体，提高新疆地区的整体医疗水平，推动新疆病理人才队伍梯队建设，提高新疆病理学基础与临床应用研究的整体水平，为新疆和兵团各族人民的健康事业做出贡献。
专业特点：集病理科团队之“医教研”优势，助疾病精准医疗向“高精尖”发展。
病理科科研力量雄厚，科研成果丰硕，近五年主持承担国家部委和各类省级科研项目71项，总经费4362.3万元，发表科研论文200余篇，其中SCI收录论文142篇；出版专著和教材26部；获得科研成果和奖励30余项，获得省级科技进步一、二、三等奖4项，获得自治区优秀学术、学位论文多篇；近五年获得发明专利和实用新型专利15项。2019年5月，石河子大学临床医学首次进入全球ESI排名前1%学科，标志着该校学科建设取得重大进展，其中在ESI临床医学发表SCI论文活跃研究学者前6名贡献者均出自于病理科。
病理科承担本科生、留学生、硕士研究生教学与临床病理培训工作，2010年来共培养硕士研究生200余名，为西北乃至全国的病理事业培养了大批优秀的病理学人才。
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