深圳市妇幼保健院儿童心理与康复科是集儿童心理疾病诊治、高危（早产）儿健康管理、发育障碍儿童的康复服务于一体的临床与保健相结合的科室，下设儿童心理门诊、高危儿门诊、康复门诊。在国内率先开展集体儿童心理保健、儿童中心游戏治疗、孤独症早期筛查与早期诊断工作。2015年8月与哈佛大学医学院合作成立了“哈佛-深圳自闭症中心”。目前科室人员12人，其中正高4人，副高1人，博士1人，硕士4人。学科带头人万国斌为国内具有影响的、资深的儿童精神与心理卫生领域专家，任中山大学公共卫生学院与华南师范大学心理学院硕士生导师、中国心理卫生协会儿童心理卫生专业委员会副主委、中国妇幼保健协会妇女心理保健专业委员会副主委、中国残疾人康复协会孤独症康复专业委员会常委、中华精神科学会儿童青少年精神医学组委员、中国儿童保健杂志和中国实用儿科杂志编委等学术职务。
专科门诊与特色服务项目高危儿门诊服务对象90%为早产儿，是卫生部“早产（儿）干预研究项目单位”，参与两个国家级早产儿追踪项目。坐诊医生为长期从事早产儿临床服务的高级专家，经验丰富，负责医院出生和全市转诊的高危儿的健康管理和追踪随访，对高危儿童和早产儿从体格生长发育、视听功能、营养状况、神经运动发育和心理发展等方面进行全方位的追踪监测和健康促进，预防和早期识别发育障碍并进行及时的治疗干预。对神经运动发育落后的儿童，于康复门诊进行物理治疗、中医针灸推拿治疗、理疗和神经运动促进治疗后，有效地促进早产儿的发育追赶和预防智力与运动发育障碍。目前门诊32周以下的低胎龄早产儿越来越多，经过追踪管理后他们能够健康成长，许多28周以内早产儿的智力、语言、运动功能发育完全正常，且不遗留任何障碍。
儿童心理门诊包括儿童孤独症、智力障碍、语言障碍、运动协调障碍、注意缺陷多动障碍、抽动症、行为障碍、情绪障碍等各种儿童心理障碍的诊断、评估和治疗干预以及儿童心理问题咨询，其中在孤独症的早期筛查和早期诊断、儿童孤独症的家庭治疗干预、儿童游戏治疗、托幼机构儿童心理卫生问题筛查等方面形成特色，处于国内先进水平。
发育行为儿科和孤独症门诊主要为各种发育障碍儿童的进行诊治与监测，其中孤独症诊疗是主要特色。自2007年开始，医院儿童心理科就负责规划与推动深圳市的孤独症早期筛查和早期干预项目，目前形成以全市社区健康中心儿童保健门诊为一级、区妇幼保健院儿童心理门诊为二级、市妇幼保健院为三级的孤独症早期筛查的三级模式。每年对全市6万多2岁以下婴幼儿进行孤独症社区筛查，并使部分孤独症儿童在2岁以内得到诊断和干预。目前医院采用与父母访谈结合对儿童进行游戏评估的方法诊断孤独症，诊断2岁以下孤独症儿童的正确率处于国内先进水平。医院与哈佛大学医学院合作成立的“哈佛-深圳自闭症中心”，将引进哈佛大学的先进经验和技术，拓展孤独症的诊疗项目，提高临床诊疗水平。
孤独症家庭干预常规开展3岁以下孤独症儿童的家庭干预训练，采取小组治疗的形式培训家长，让家长理解日常互动与游戏对孤独症干预的重要性，学习采取非言语沟通、多元沟通、经验分享式互动的技巧，在日常游戏和惯例性活动中干预孩子，在改变父母与孩子沟通的技能后带动孩子提高社会化能力。治疗周期为6周，每周一次两个小时。
儿童游戏治疗与亲子游戏治疗自2005年开始在国内率先开展儿童中心游戏治疗，该方法不同于一般的行为治疗，不去治疗和处理儿童的行为问题，而是提供一个游戏的环境，采用以儿童为中心的人本主义心理学理论为指导，接纳儿童、感受儿童、理解儿童的情绪与感受，通过建立治疗师与儿童的关系，提升儿童内在成长动力而达到治疗的效果。治疗对象主要为3-7岁儿童，适用于各种情绪问题、轻度行为问题与成长问题等。采取集体治疗的形式，将游戏治疗理念与方法教给家长，让家长在家里进行亲子游戏治疗，收效更好。亲子游戏治疗周期4-6周，每周一次两小时。
儿童行为管理培训儿童多动、行为磨蹭、对立违抗、行为难以管理等让父母在养育孩子时精疲力歇，医院开展的父母行为管理培训班可以让父母管理孩子时边轻松，有效地处理孩子的行为问题。培训周期6-8次，每周一次2小时。
儿童心理评估医院拥有最齐全的的心理评估工具，包括各种智力测验、各种发育诊断量表、学龄前语言诊断量表和汉语沟通发展量表、Peabody运动发育评估量表、儿童孤独症评定量表（CARS）、孤独症观察诊断量表（ADOS）、孤独症访谈量表（ADI-R）和阿斯伯格综合征诊断量表（GADS），Conner-3等行为评估量表，感觉统合功能量表等，气质与个性量表。
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