台州医院肛肠科是台州医院重点发展的学科之一，经过近几年的不懈努力，已发展成为台州地区具有中西医结合特色的肛肠诊疗中心，在省市乃至国内、外享有良好的声誉。主要开展大肠肿瘤、痔、肛瘘、肛裂、便秘等肛肠常见疾病的诊断治疗，对肛肠科疑难疾病的诊治有丰富的临床经验。
有以下几个特点：1、强大的人才队伍。目前拥有主任医师2人，副主任医师2人，研究生以上学历3人，是集医疗、科研、教学、预防为一体的，具有特色的中西医结合肛肠诊疗中心。
2、拥有设备先进、功能完善的诊疗中心。开展无痛肛镜、肛肠造影、肛门部疾病的小手术室等。
3、雄厚的技术力量。开展常规的痔、瘘手术，及具有特色的治疗；痔上粘膜环切术（PHP术）、复杂性肛瘘手术、直肠癌TME、直肠癌超低位保肛手术、全结肠切除、回肠贮袋手术等；尤其是腹腔镜下结直肠癌根治术在全省处于领先。
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