泉州市第一医院病理科始创于1963年10月，经过50多年的不懈努力，积极进取，如今是国家级病理医师规范化培训基地，并承担全院的临床病理、细胞学检查及病理科研教学工作，同时担负该地区疑难病理会诊任务；该科目前除该院四个院区的日常工作外，同时承担台商投资区医院、惠安县医院、医博肛肠医院、丰泽区玛丽医院等的相关病理会诊工作。
病理科技术力量较雄厚，学科队伍结构较合理，科室现有医师13人，技师14人，其中硕士生导师1人，主任医师3人，聘任教授1人，硕士研究生及以上8人。科室内配置较完善，设施较先进，有免疫组化室、细胞室、分子病理学实验室及病理图像分析系统、远程病理会诊系统等。
病理科年外检工作量近40000例，术中快速冰冻检查每年2千多例；组织化学及免疫组织化学45000多片/年；年开展体表肿块穿刺细胞学检查、脱落细胞学检查2万多例，基因检测1000多例/年，承担泉州地区宫颈癌筛查TCT及HPV检测，承担泉州地区医疗鉴定(尸体解剖)等工作，病理科近几年来积极引进新技术和开展新项目，该科在全市较早开展EGFR、ROS1、ALK、K-RAS、BRAF等靶向基因的检测、HPV24基因分型、乳腺癌HER-2DISH检测等技术。
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