重庆市第五人民医院泌尿外科始建于1979年。1980年重庆市卫生工作会议上定为重庆市重点科室。目前拥有床位28张，年门诊量约3000人次，年手术300多台。现有医护人员14名，医师6名，其中主任医师1名，副主任医师1名，硕士2名。
重庆市第五人民医院泌尿外科下设：★内腔镜手术室★尿动力学检查室★体外冲击波碎石中心拥有较完善的内腔镜监视系统、图象采集系统。Olympus前列腺电切镜、尿道切开镜、大力士碎石钳、Wolf输尿管镜、瑞士EMS气压弹道碎石器、Olympus肾镜。Dantec尿动力学检查检查仪。体外冲击波碎石器（ESWL）。
重庆市第五人民医院泌尿外科在1958年开始收治泌尿外科病人，开展泌尿系肿瘤、结石、先天性畸形以及泌尿系梗阻和外伤等疾病的诊治工作，能够完成肾癌根治术、膀胱全切及尿流改道以及肾上腺肿瘤等大手术。1993年以来主要开展了下尿路疾病的腔镜手术如：经尿道前列腺电切术、汽化术；前列腺激光消融术；经尿道膀胱肿瘤电切除术和经尿道狭窄切开术等内腔镜手术。特别在高龄、高危前列腺增生症的手术治疗中取得了较好的临床效果。2000年又开展了输尿管镜检查术、输尿管镜取石术以及泌尿系结石的腔内气压弹道碎石术。近期又开展了经皮肾碎石术，泌尿外科腹腔镜手术，以及尿动力学检查和ESWL。至今，已完成上千例内腔镜手术，形成了以腔内泌尿外科治疗泌尿系疾病为主的特色科室。近期开设了女性及小儿泌尿外科专科门诊。
重庆市第五人民医院泌尿外科在科研方面，先后获得重庆市卫生局医学科技成果三等奖3项，南岸区科技成果二等奖1项，三等奖2项。国内发表论文20余篇。该科是重庆市泌尿外科专业委员会、市抗癌协会泌尿、生殖肿瘤学会、市医疗事故鉴定委员会泌尿外科专业等学术委员会的委员单位。
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