重庆医科大学附属口腔医院（重庆市口腔医院）前身是由国民政府中央卫生实验研究院于1943年10月成立的“沙坪坝牙病防治所”。1946年7月，成立“重庆市牙病防治所”。1955年7月成立“重庆市口腔病医院”，成为全国最早建立的四大省市级口腔专科医院之一。1995年7月，更名为“重庆市口腔医院”。2001年7月，经重庆市政府批准，医院成建制划归重庆医科大学，成为重庆医科大学附属口腔医院，组建口腔医学系，2005年成立口腔医学院。
学院现有在岗职工721人，其中专业技术人员649人，其中专职教师125人，其中教授14人，副教授32人，具有博士学历21人，硕士学历64人。学院现有博士生导师（含兼职）4人，硕士生导师（含兼职）42人。有2名教师为“重庆市中青年骨干教师。
学院下设口腔颌面外科学、牙体牙髓病学、牙周病及粘膜病学、口腔修复学、口腔正畸学、口腔预防医学、儿童口腔医学及口腔基础医学八个教研室，口腔设备学、口腔专业外语、口腔解剖生理学、口腔颌面影像诊断学、口腔材料学五个教学组，承担口腔医学本科专业课程的理论教学和实验教学工作。
口腔医学专业2009年被重庆市教委评为“重庆市特色专业”和“重庆市重点学科”。口腔医学实验教学中心是“重庆市高等学校实验教学示范中心”。《儿童口腔病学》、《口腔解剖生理学》、《口腔正畸学》、《牙体牙髓病 学》为校级精品课程.。
学院从2000年开始招收口腔医学专业本科学生，办学迄今已培养9届356名本科学生，本科考研率40-60％，就业率100％。2001年开始招收硕士研究生，迄今已招收博士研究生41名，硕士研究生324名，其中外籍硕士研究生18名，分别来自毛里求斯、印度、尼泊尔等国。
学院每年在口腔高年级学生中开展的“口腔技能比赛”，积极倡导和践行对学生的“三早”教育实践。2011年我院08级口腔本科学生同学带领的"点彩"团队作品《新型有机高分子义齿代型底台的研发》在全国大学生“挑战杯”比赛中荣获一等奖。2005年以来，每年12人次获得“贺利氏”奖学金。
学院重视对青年教师的培养，常年开展有“青年教师讲课比赛”、“英语讲课比赛”、“优秀教案评比”、“我最喜爱的带教教师”评选、 和“根管治疗竞赛”、“急救知识竞赛“等活动，经常组织教师参加全国各类竞赛和教学活动，让青年教师在丰富多彩的教学活动中不断成长，2013年学院教师在中华口腔医学会青年教师授课大赛中获得二等奖等荣誉。近五年来，学院教师承担教学研究项目22项，其中市教委教改课题10项，其中重大项目1项，重点项目2项；发表教学论文31篇；获重庆医科大学校级优秀教学成果二等奖3项；编写、参编出版着作14部主编、参编出版教材7本，编写自编实验教材7本。
近3年，学院共获准立项各级科研课题116项，其中国家级项目5项、省部级项目22项、厅局（校）级项目59项、院级项目25项；获得各类基金科研经费542.4万元；获得重庆市科技进步奖一等奖1项，重庆市科技进步奖三等奖1项，重庆市卫生局一等奖1项，二等奖4项，三等奖3项，卫生局科技成果二等奖1项；发表学术论文276篇，其中SCI或EI收录30篇，核心期刊有172篇。
学院目前与多家知名国际国内口腔医学研究机构建立交流合作关系：美国南加州大学口腔医学院颅面分子生物研究中心、牛津大学欧洲癌症研究中心、美国芝加哥大学分子肿瘤研究中心、哈佛大学Forsyth研究中心、美国阿拉巴马大学骨代谢疾病研究中心、新加坡分子医学科学研究所、武汉大学口腔医学院口腔生物医学教育部重点实验室、第四军医大学组织工程研究中心、西南大学生命科学院分子发育生物学重点实验室等。
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