包医二附院消化科始建于20世纪80年代，历经近40年的发展，是自治区首创的消化内外整合学科，集临床、科研、教学为一体，被评为自治区消化内科领先学科、自治区消化内科质控中心、自治区消化病研究所。先后被评为国家消化系统疾病临床医学研究中心包头基地、一带一路“友谊”消化内镜直通车万里行内蒙古总站、中华医学会消化内镜专科医师培训中心内蒙古培训基地、中国医师协会“消化内镜医师培训基地”、“中华医学会”、“中国食管胃静脉曲张诊治规范基地”等多个培训基地，及消化疾病防治内蒙古自治区工程研究中心、国家消化道早癌联盟、国家消化病临床研究中心早期胃癌筛查研究协同网络协作中心、食管疾病规范诊治公益项目内蒙古自治区规范诊治联盟等，并获选自治区“草原英才”工程产业创新人才团队、内蒙古自治区“服务百姓健康先进集体”。
目前科室医务人员达100余人，其中国务院特贴专家1人，内蒙古自治区“草原英才”2人，包头市“鹿城英才”3人，包头市名医人才培养工程及后备人才4人，硕士生导师8人，博士研究生5人，在读博士7人。科室分病房、内镜中心、门诊三个诊疗区域。病房设床位200张，设有四大综合诊疗中心：消化微创中心、胃食管反流多学科诊疗中心、胰腺疾病诊疗中心、IBD诊疗中心；内镜中心总面积3000余㎡，共设操作间12间；门诊设立胃食管反流病门诊、便秘门诊、肝病门诊、胆胰门诊、消化道早癌筛查门诊、IBD门诊及消化介入门诊等多个专病专科门诊。
科室长期开展无痛胃肠镜检查、ERCP（经内镜逆行性胰胆管造影术）、ESD（内镜粘膜下剥离术）、POEM（经口内镜下食管括约肌切开术）、EUS-FNA（超声内镜引导下穿刺术）、胃食管反流病射频治疗术、食道胃底静脉曲张硬化套扎术、消化道狭窄扩张和支架置入术等消化内镜下诊疗技术，及腹腔镜下胆囊切除术、保胆取石术、胃底折叠术、左右半肝切除、胃肠癌根治术等外科微创手术，其中数项技术具自治区乃至国内领先水平。
近年来承担国家、自治区及盟市及科研50余项，相关研究成果获各级科技奖项近20项。近8年来共发表论文155篇，其中SCI8篇。
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