胃肠专科主要诊治胃肠道肿瘤、腹部肿瘤、腹部外伤、消化性溃疡及并发症、各类急腹症。规范开展胃肠癌根治手术，近几年大力开展腹腔镜手术，目前已完成腹腔镜下各段大肠癌根治术、胃癌根治术、胃大部分切除术、胃穿孔修补小肠肿瘤切除、阑尾切除术、肠粘连松解术。其中腹腔镜下大肠癌根治术获2005年院科技进步奖。
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