泌尿外科始创于1953年，是江苏省医学重点学科、江苏省临床重点专科、南京市医学重点学科，是国家卫计委授权的达芬奇手术机器人中国泌尿外科临床手术教学示范中心、冷冻消融技术（氩氦刀）中国区临床应用示范中心、卫生部内镜诊疗技术培训基地、国家泌尿肿瘤临床药理基地、江苏省机器人手术治疗中心。为南京大学医学院、南京医科大学、东南大学医学院及南京中医药大学硕士和博士学位授予点。现有医护人员100余人，其中主任医师、教授4人，博士生导师2人，硕士生导师8人，副主任医师、副教授10人。编制床位130张，年门诊10万余人次，住院手术4800余台，门诊手术1000余例，出院5000余人次。内设四个病区、B超声检查室、体外冲击波碎石室、尿动力学检查室、泌尿系统影像学教研室、泌尿系统病理学教研室、泌尿外科学研究所。
特色医疗1、泌尿系肿瘤的特色治疗：开展了B超及CT实时监测下冷循环射频消融治疗肾上腺肿瘤、肾脏肿瘤、膀胱癌和前列腺癌；B超实时监测下氩氦刀冷冻治疗肾脏肿瘤、肾上腺肿瘤、氩氦刀冷冻治疗前列腺癌；局限性前列腺癌近距离放疗（碘125粒子内照射）等技术。开展了耻骨后前列腺癌根治术、经会阴前列腺癌根治术和腹腔镜下前列腺癌根治术，并开展了晚期膀胱癌和前列腺癌化疗。
2、肾移植手术（为卫生部移植准入单位）：开展了同种异体肾移植、肝肾联合移植术，尤其是亲属肾脏移植位居全国前列，年完成亲属供肾肾移植50余例，迄今，共完300余例，其中夫妻间肾脏移植手术占10%。
3、泌尿微创手术（为卫生部内镜诊疗培训基地）：开展后腹腔镜下肾上腺肿瘤切除术、肾癌根治性切除术、保留肾单位肾切除术、上尿路上皮性肿瘤的根治性手术、盆腔淋巴结清扫术、膀胱癌根治性切除术、前列腺癌根治性切除术；肾蒂淋巴管结扎术、肾切除术、腔静脉后输尿管成形术，肾盂输尿管交界处成形术、巨输尿管成形术、膀胱阴道瘘修补术，腹腔镜手术占年手术的90％以上。前列腺增生症的微创治疗率在98％以上。同时完成大量经皮肾镜碎石术、经皮肾癌射频消融术（含孤立肾）、经皮肾癌冷冻术和经皮肾上腺肿瘤治疗术等微创手术。同时为即将开展的机器人手术进行了系统的人员培训。
4、尿结石的诊治：完成2000余例复杂肾结石微创治疗（mPCNL）和6000余例输尿管镜下碎石术，完成100余例后腹腔镜下输尿管切开取石术；完成2万余例体外震波碎石术，有效率95％以上。开展了电子输尿管软镜微创治疗上尿路结石的治疗，获得满意疗效。泌尿系结石的系统治疗技术获得了2011年江苏省科学技术奖一等奖和中华医学科技奖二等奖。
5、尿动力学：开展TVT，TOT手术治疗女性压力性尿失禁、人造尿道扩约肌置入治疗完全性尿失禁、Interstim电刺激起搏器治疗神经源性膀胱、记忆合金支架放置治疗膀胱出口梗阻等。
6、男科学：男性性功能、男性不育检测以及可膨胀阴茎假体置入术、阴茎血管分流术、阴茎硬结症和阴茎短小症的矫正术、阴茎持续勃起，难治性不孕不育症等治疗。
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