呼吸内科依靠科技和学术谋求发展，科室逐渐壮大，目前已成为集医疗、教学、科研于一体的综合型呼吸疾病的诊疗科室。科室是国家药监局临床药物试验基地、南京医科大学硕士生培养点，主持多项卫生部、浙江省等科研课题、连续两年主办浙江省间质性肺疾病继续教育项目。现有主任医师2人，副主任医师4人，博士和硕导1人，硕士研究生4人。
【诊疗项目】呼吸衰竭病人的机械通气治疗；经纤维支气管镜进行气道内冷冻治疗、肺活检、支气管肺泡灌洗；呼吸功能测定、支气管激发试验和舒张试验；睡眠呼吸监测与无创机械通气治疗；经皮肺穿刺技术等项目。近年来在慢性阻塞性肺病、呼吸衰竭、肺部感染、支气管哮喘、肺癌等呼吸系统常见疾病诊治方面积累了丰富的经验，并显示出自己的独到之处。
间质性肺疾病的诊治成为呼吸科的一大特色，先后诊治了众多诸如弥漫性泛细支气管炎、过敏性肺炎、特发性间质性肺炎、肺泡蛋白沉积症、卡氏肺孢子菌病、肺奴卡氏菌病、结节病等疑难病症，成功举办了“浙江省间质性肺疾病继续教育学习班”，发表多篇间质性肺疾病的学术论文，得到省内同行认可。
呼吸科非常重视学科建设，把学科建设作为提升科室整体素质的重要内容，以“建设学习型科室，建设省内一流呼吸科”为其发展方向，先后已有数名医师在上海中山医院、北京协和医院、山东省立医院研修学习，科室内部注重业务培训，营造浓厚的学术氛围。提高学术水平和诊疗水平已经成为科室发展的主旋律。
呼吸科还肩负南京医科大学硕士研究生、七年制、五年制医学生的理论教学、临床实习和进修医师培训等多项教学任务，良好的师德、高超的医疗技术和出色的教学水平赢得学员们一致赞赏。
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