小儿眼科是眼科中心既有实力又特色鲜明的学科之一，拥有以学成归国的王乐今主任医师为首的一支年富力强的人才梯队，及一系列世界一流的眼科临床和实验室仪器设备，在斜视、弱视、小儿眼科、眼科遗传病的临床诊断、治疗和科研方面居国内领先水平。
本中心设立了规范化的小儿眼科专家与专科门诊、弱视训练室和小儿视光中心，本着“一切为患者着想、急患者所急”的理念，每天（包括周末）都设专科门诊。专家门诊为每周一、五上午和周三下午；为方便外地患者和学生就诊，将弱视训练治疗时间，特设为周一至周五每天下午13：30至19：30进行，周六上午8：00至12：00，特殊情况（患儿多或寒暑假）时，做到患儿随来随治疗。自2004年1月开始以来，每天有50余位患儿在此训练并获得良好的疗效。小儿视光中心进行青少年儿童的屈光不正矫正和治疗，尤其是利用双眼视的概念指导青少年的屈光矫治达到治疗视疲劳和延缓、减轻青少年近视发生发展的目的。为了更好地服务患者，本中心将进一步扩大规模并改善就诊环境。
中心拥有四间独立的眼科手术室，设备配置达国际先进水平；并有多台同视机、OCTOPUS视野计、OCT、角膜地形图仪、Zeiss荧光造影系统、手术显微镜和多种弱视治疗仪器及软件，可为患者提供检查、非手术治疗和手术治疗等服务。此外，中心还引进了国际先进的RetcamⅡ广域数字化小儿视网膜图像系统，可以快速、准确的检查小儿眼底，得到清晰、全面的眼底图像，无创伤，无痛苦，并记录每一次检查的图象，便于跟踪、随访。RetcamⅡ对视网膜母细胞瘤、婴儿摇晃综合症（SBS）、早产儿视网膜病变的检查与诊断有极大的帮助。
科内专业医师全方位开展针对斜视的手术与非手术治疗，已为众多共同性斜视、麻痹性斜视及A-V综合征、DVD、先天性眼外肌纤维化、旋转性斜视、Brown综合征、斜视矫正术后的残留性斜视等特殊类型斜视患者进行了治疗；同时开展小儿眼病的诊治工作，如早产儿视网膜病变、视网膜母细胞瘤、Coats病、先天性白内障及先天性青光眼等。凭借丰富的临床经验，为许多在基层医院手术治疗失败的病例进行了手术修复，取得了满意的疗效。本学科的发展目标是成为国内一流大学教学医院的眼科专业，为各级医院做手术示范，并培养输送高水平的临床医师。
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