1955年，创始人为蜚声中外的著名临床医学专家、我国临床微生物学的奠基人戴自英教授，医术精湛、在医学界享有很高威望的感染病学家徐肇玥教授、刘裕昆教授、汪复教授、张婴元教授、翁心华教授、金向涛、王嘉瑞、孙涛等相继任感染病学科负责人，数十年来在传染病的临床科研工作中已形成学科特色和优势。感染病学科1978年获准为国家教委首批博士点，1989年为国家教委首批重点学科，1996年进入国家教育部211重点工程，2001年评为国家重点学科，数十年来在诊治经典传染病及感染病的医疗、教学、科研工作中已形成学科特色和优势，是国内重要的病毒性肝炎相关肝病和其他感染病临床医疗中心之一。2011年度中国医院最佳专科声誉排行榜中，华山医院感染科蝉联传染科第一位。
感染病科现任科领导是张文宏、张继明、王明贵教授。其中多名教授、副教授在各种学术组织中担任重要地位。拥有如戴自英、徐肇玥、邬祥惠、翁心华等一批全国知名的老专家，也拥有一大批在学术界相当活跃的中青年教授，已形成一支高学术水平的人才梯队。感染病学科的科研力量极为雄厚，是国家科技部(原国家科委)六五、七五、八五、九五、十五以及十一五攻关项目的承担者，近5年来，华山医院感染病学科科先后承担了国家科技部973计划1项、863计划2项、十五攻关项目3项、卫生部临床学科重点项目2项、国家自然科学基金项目10多项，目前还承担国家十一五重大传染病攻关项目4项、国家教育部博士点基金1项、上海市科委重点项目2项，并获得国家级、省部级科学成果奖20余项。研究方向是包括：病毒性肝炎的免疫发病机制研究，耐药的诊断方法与耐药监测以及个体化治疗，发热待查以及新发和再现感染性疾病的诊断，耐多药结核病的分子机制研究及其快速诊断技术的研制，深部真菌病的新型诊断方法和治疗研究等方面。
科室收治的经典传染病以及其他各项感染的病人之多、病种之丰富在全国综合医院的感染病科中是不多见的。华山医院感染科依靠新兴的临床诊断技术，特别是近年来在分子生物学技术诊断感染性疾病方面的研究所获得的进展，如肝炎病毒的变异检测、病毒基因分型的检测与研究、结核病和深部真菌病的快速诊断等技术为疾病的合理诊治提供的坚实的基础。
2010年7月28日起，坐落于华山医院东南面的新建感染病大楼启用，开始收治肝炎病人以及其他感染病人，标志着院感染科在诊疗技术的硬件水平上又提高了一个层次。这幢两年前动工兴建的大楼总面积约9010平方米，是列入该市“加强公共卫生体系建设3年行动计划”的一个重要项目，共有地下2层和地上5层。配有先进的管理和舒适的病房设施。各病区都设有重症监护正压病房，配备监护仪、吸引装置、抢救设备，其洁净等级更是达到十万级，为重危免疫缺陷患者提供了一个有利的治疗和康复环境。新建感染病大楼将成为集科研、医疗、教学为一体，并具有疑难重症诊治水平和应急救治能力的传染病专科诊疗中心。
华山医院感染病科在病毒性肝炎相关肝病的个体化与优化治疗、中枢神经系统感染诊治、不明原因发热和新发感染性疾病的诊治、深部真菌病的诊治等方面的实力雄厚，相信会给来自全国各地的感染病患者带来福音。
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