肛肠科的前身是痔瘘科，始建于上世纪三十年代末，80多年来，历经数代人的传承和努力，目前已发展为市级、省级中医重点专科，国家中医药管理局“十二五”重点专科建设单位、国家卫生部、国家中医药管理局、解放军总后勤部联合表彰的“全国综合性医院中医药工作示范单位”。
肛肠科是川南地区规模最大、技术力量最强、专科诊疗仪器设备最多，人才梯队建设合理的中西医结合肛肠专科，现有高级职称专家8人，硕士研究生6人。80多年来共收治了包括港澳台地区在内的全国数以十万计的患者，深受广大患者的赞誉。
肛肠科在继承传统疗法的基础上，诊疗技术不断进步，除了在治疗痔病、肛瘘、肛周脓肿、肛裂等方面是传统强项外，不断提升技术水平，在无痛微创的肛肠技术上又前进一步，同时对炎性肠病、各种顽固性便秘等病症的诊疗方面有独到之处，还在大肠肿瘤诊治，特别是中西医结合治疗低位直肠癌及中西医结合参与围手术期快速康复疗法等方面积累了丰富的经验。在低位直肠癌保肛手术方面具有特色，还在西南片区独家引进德国原装经肛门内镜显微手术系统（TEM），为更多的患者提供了先进的微创治疗服务。
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