福建医科大学附属协和医院消化内科在我国着名消化系疾病专家陈锡谋教授、林谷珍教授、王小众教授的先后领导下不断得到发展，现为福建省临床重点专科、福建医科大学重点学科，是福建省消化系疾病临床诊疗中心之一。消化内科现有53张病床的独立消化病区、消化内镜室与胃肠功能检查室。学科现有主任医师5名，副主任医师6名，主治医师1名，住院医师6名，其中博士学位10人，硕士学位6人，拥有很强的人才梯队和师资力量，综合实力在福建省消化系病领域保持领先的地位。学科带头人为王小众教授，科主任为陈丰霖主任医师，科副主任为张莉娟、李丹副主任医师。
作为福建省的消化系病临床诊疗中心，消化专科年专科门诊量超过7万人次，每年收治超过1800名的消化系疾病住院患者，其中福建省内及周边省份的外埠患者占相当比重。病床使用率超过100％，消化系疾病的病种齐全，成功救治了大量消化系急、危、重症患者，在上消化道大出血、急性出血坏死性胰腺炎、肝硬化肝性脑病、严重败血症、休克等危重病症的抢救治疗上达到省内最高水平。
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