昌吉州人民医院传染病院是昌吉州人民医院下属的，以各种急慢性肝病、肝硬化及并发症、黄疸待查、结核病和其它传染病、社区常见疾病诊治等为主，集肝病、传染病、内科常见病、社区服务为一体的综合性医院。分院共有职工40人，其中高级职称5人，中级职称10人，初级职称19人。分为传染病分院、社区卫生服务站两部分。
社区卫生服务站设有社区门诊、专家门诊、计划免疫、门诊治疗室、门诊医技、检验室、B超室、放射室、心电图室等诊室。传染病区有床位35张，医护人员22人，其中高级职称6人，中级职称5人，均具有丰富的临床经验。
诊疗范围：各种传染病、急慢性肝炎、肝硬化及并发症、重症肝炎、肝性脑病、黄疸待查、肺结核及结核性脑膜炎等肺外结核病的诊断与治疗。传染病分院也是全球基金项目艾滋病医疗救治定点医院及免费自愿咨询点，开展了艾滋病自愿咨询检测、艾滋病免费抗病毒治疗、艾滋病机会性感染的治疗。
医疗设备：设有WLXGX-888型伟力血液净化-人工肝支持系统、WLFHY-500型电脑腹水超滤·浓缩回输系统、WLGY-801型低频脉冲电脑肝病治疗仪等先进仪器。
医疗特色：目前传染病分院在各种肝病尤其疑难肝病的诊断治疗上已达到疆内先进水平，在结核病、腹泻及其它传染病的诊断治疗上已居全州前列。在肝硬化并发症的非手术治疗上具有独特优势；因人因症而异的个体化用药方案使我院在结核病的治疗上显示了独特的疗效；与州人民医院导管室联合开展的介入诊断治疗使分院的诊治技术又上了一个新的台阶；昌吉州唯一一家艾滋病医疗救治定点医院，对符合抗病毒治疗的艾滋病病人提供免费抗病毒治疗药物。社区卫生服务站可使社区患者就近享受便捷、价廉的医疗服务。
服务特色：2.肝病住院患者花院内会诊费用，可享受新疆一流专家的诊治
3.主管医师为住院病人提供出院后持续性的医疗咨询服务
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