南京大学医学院附属鼓楼医院普外科是国家重点学科、首批国家临床重点专科、江苏省医学重点学科、江苏省临床重点专科、江苏省消化系统疾病及消化道肿瘤临床医学中心、江苏省肝脏外科临床医学中心、南京市普通外科临床医学中心、南京大学肝胆研究所、南京大学、南京医科大学、东南大学、南京中医药大学博士、硕士学位授予单位，博士后科研流动工作站、卫生部内镜专业技术普通外科培训基地、普通外科专业国家药物临床试验机构、国家专科医师规范化培训制度试点专科培训基地、江苏省外科基本技能培训基地。学科设有肝胆研究所、肝胆胰中心、胃肠中心、甲乳外科及外科B超室，目前开放床位358张。现有医师89人，主任医师22人、副主任医师15人，教授5人、副教授13人。近年来获得科研课题255项，其中国家级41项，省级110项，市级104项；获江苏省科技进步一等奖3项、二等奖3项、国家教育部二等奖1项、中华医学科技二等奖1项、中华医学科技三等奖1项、江苏省新技术引进一等奖4项。
特色医疗肝胆胰中心：设有肝脏外科及移植外科、肝胆外科、胆胰外科（8C、9A、9B）三个病区，编制床位186张。特色技术：1、肝移植技术：经典或背驮式肝脏移植、活体肝移植、劈离肝移植、多米诺肝移植、辅助肝移植、成人间“废弃肝脏标本”肝移植、人造血管替代腔静脉和5，8段肝静脉的不带肝中静脉成人活体右半肝肝移植等；肝肾联合移植、成人的腹腔器官簇联合移植等多脏器移植；2、肝切除技术：半离体或离体肝切除技术、精准肝切除、腹腔镜肝切除术；3、胰腺手术：腔镜下或机器人辅助胰十二指肠切除、保留脾脏胰体尾切除、胰头癌扩大根治术等胰腺手术。
胃肠中心：分设9C胃外科、9D结直肠外科，包含腹壁疝外科。ICG导航腹腔镜胃癌根治术、纳米碳导航腹腔镜胃癌根治术、腹腔巨大肿瘤切除术、低位直肠癌经肛提肌外腹会阴联合切除术、组织再生材料盆底重建、腹腔镜下低位直肠癌原位人工肛门重建术、复杂切口疝的修补重建。
甲乳中心：乳腺癌的综合规范化治疗，包括：乳腺癌改良根治术、保乳手术、前哨淋巴结活检术、乳腺癌术后I期乳房重建术、腔镜辅助下乳腺手术、（新）辅助化疗、内分泌治疗等；规范性的甲状腺、甲状旁腺手术，腔镜（辅助）下甲状腺、甲状旁腺手术。
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