科室创立于1998年，现有专业技术人员9人，其中主任医师1名，副主任医师1名，博士学位2人，硕士学位者占75%。有3人兼任省级及市级专业委员会委员。科室主要承担省内及外省周边地区的先天性心脏病患儿的治疗。
科室目前开放床位30张，其中心外科监护室内设监护单元8套，配备有国际先进的呼吸机、监护仪等设备。目前心脏外科年手术量约300台，总治愈率98%以上，特别是新生儿复杂先天性心脏畸形的手术成功率处于省内领先水平。同时，该科与北京阜外医院、上海交通大学附属上海儿童医学中心、首都医科大学附属北京儿童医院建立密切联系，聘请我国著名先天性心脏病专家李守军教授为客座教授，并定期来该院指导、参与各类复杂先天性心脏病手术。
主要疾病诊疗范围常规开展房间隔缺损、室间隔缺损、心内膜垫缺损、心脏瓣膜疾病、法洛氏四联症、右室双出口、肺静脉异位引流、大动脉转位、三房心、主动脉缩窄、主动脉弓离断、肺动脉闭锁等先天性心脏病手术的矫治。近期已成功开展小切口房间隔缺损、室间隔缺损修补手术。相对于常规手术，该手术方式切口明显缩小、创伤小、恢复快。开展食道超声引导下经胸介入房间隔缺损、室间隔缺损、肺动脉瓣狭窄矫治术，不用体外循环、创伤小、手术时间短，同时避免了传统介入方法带来的射线辐射。
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