黄连具有清热燥湿、泻火解毒的功效，主要用于湿热痞满、呕吐泻痢、高热神昏、心火亢盛、目赤牙痛、痈肿疔疮等病症。
1、清热燥湿
黄连性寒味苦，能清除体内湿热邪气。对于胃肠湿热引起的腹泻、痢疾，常与木香、白芍配伍使用。现代研究表明，黄连中的小檗碱可通过抑制肠道病原微生物生长缓解症状。典型方剂如葛根芩连汤可用于湿热型腹泻。
2、泻火解毒
黄连擅长清泻心胃实火，对热毒炽盛引起的疮疡肿痛效果显著。临床常用黄连解毒汤治疗疔疮痈肿，其有效成分黄连素能抑制金黄色葡萄球菌等致病菌。外用时可将黄连研末调敷患处，配合口服疗效更佳。
3、抗菌消炎
黄连提取物对多种细菌、病毒具有抑制作用。药理学证实其抗菌谱包括痢疾杆菌、结核杆菌等，适用于细菌性肠炎、呼吸道感染。成药黄连上清片可用于风热上攻引起的咽喉肿痛，但须注意脾胃虚寒者慎用。
4、调节血糖
黄连中的生物碱成分能改善胰岛素抵抗，辅助降低血糖水平。二型糖尿病患者可在医生指导下配合使用黄连素片，但不可替代降糖药物。使用期间需定期监测血糖，避免与格列本脲等磺脲类药物联用。
5、保护心血管
黄连提取物有助于扩张冠状动脉，改善心肌供血。其抗心律失常作用对室性早搏有一定效果，常与苦参、丹参配伍。临床可见黄连碱注射液用于病毒性心肌炎辅助治疗，但须在专业医师指导下使用。
使用黄连时需注意其苦寒特性，脾胃虚弱者应配伍党参、白术等健脾药物。不宜长期大量服用，以免损伤脾胃阳气。孕妇及过敏体质者慎用，儿童用药须严格遵医嘱。建议将黄连置于燥湿类食疗方中使用，如黄连阿胶汤可滋阴降火，配合规律作息效果更佳。出现不良反应应立即停用并就医。
