神经外科是外科系列中具有代表性的具有诊疗特色的科室，科室拥有48张床位，设有25病房。14个高级病房，房间内均有电视、卫生间等设施。为病人提供温馨，舒适的治疗、休息环境。该科现有医护人员26人，其中主任医师1名，副主任医师4名，主治医2名，医师1名，硕士研究生1名；护士共18人，其中副主任护师1人，主管护师2人，护师3人，护士12人，已发表国家级论文10余篇，省级论文10余篇。敦化市医院神经外科是全市规模最大，设备最全，技术最精湛的神经外科专科疗区，多年来肩负着该区域的神经外科预防及救治工作，对各种神经外科疾病的治疗积累了丰富的经验。疗区在神经外科方面进行各种脑外伤的规范治疗，担任了敦化地区颅脑创伤的主要治疗工作。
开展诊疗项目颅脑损伤：各种硬膜下血肿、硬膜外血肿、脑挫裂伤、脑内血肿、原发性脑干损伤、颅骨骨折、颅骨缺损；
颅内肿瘤：大脑凸面肿瘤；头皮及颅骨疾病：各种头皮肿物及颅骨骨瘤；颅内感染性疾病：脑脓肿；特色诊疗项目脑血管性疾病：高血压性脑出血、大面积脑梗塞的手术治疗。
颅脑损伤：各种硬膜下血肿、硬膜外血肿、脑挫裂伤、脑内血肿、颅骨骨折、颅骨缺损。
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