59医院普通外科的前身是外二科，创建于1954年，至今已有50余年的历史。经过几代人的努力，各个专业迅速发展，先后分出心胸颅脑外科、泌尿烧伤外科之后，肝胆胃肠专业依其独特的优势蓬勃发展。在院党委领导下，中心平稳健康发展，于2006年6月该中心下设普通外科和肝胆外科。
59医院普通外科专业领域先后开展了全胃切除、小肠圈代胃术、全结肠切除术、J型空肠直肠吻合术等术式，2003年率先在云南省开展了在腹腔镜下结直肠癌根治术，并取得了满意疗效，近年又开展了腹腔镜下全结肠切除、腹腔镜下甲状腺切除、腹腔镜下阑尾切除术等微创术式。在此基础上科室又先后开展了拖出式低位直肠癌根治保肛术，小儿先天巨结肠症一期切除吻合术、双吻合器在小儿先天性巨结肠症中一期根治切除吻合术、痔上粘膜环切术（PPH）、大隐静脉腔内激光治疗术、乳腺肿瘤切除一期乳房再造术/一期假体植入术等国内先进术式，在滇南处于领先水平。
59医院普通外科编制床位30张，实际展开床位60张，病区使用面积1600㎡，现有工作人员30余人，其中高级技术职称的有3人，中级技术职称的有4人，年门诊人数12000余人次，年毛收800余万元。目前专科医疗设备总价值近400余万元，基本满足临床医、教、研工作。全科在省以上医疗期刊发表医学论文60余篇。其中《脑垂体后叶素在胆道手术中的应用》一文应邀在美国洛杉机国际外科学年会上交流。普通外科多次被上级党委评定为基层先进单位。
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