儿科呼吸病专业建立于1978年，经过孙荟琴、林慈、李鸿仁、吴凤宝和张灵恩教授的努力，呼吸专业有了很大的发展。目前学科带头人为王立波主任医生，呼吸专科有22名专科医生，其中4名主任医生，6名副主任医生和8名主治医生。专科医生中博士学历有7名，硕士学历有12名，其中1名博士生导师，4名硕士生导师，具有完善的医疗和科研人才梯队。本专业侧重解决小儿呼吸道疾病的临床诊断、治疗和预防工作，重症疑难及罕见儿童肺部疾病诊治是学科发展的重点方向。
呼吸病专业有统一管理的呼吸病专业病区、呼吸专科门诊(包括儿童哮喘、慢性肺病专病门诊)，并配有纤维支气管镜室、肺功能室(包括常规肺功能、婴幼儿肺功能、婴幼儿体描、支气管激发试验、呼出气NO)、呼吸睡眠异常诊断中心、雾化治疗室及特异性免疫治疗室。借助于本院的辅助检查平台，能够对患儿进行免疫学、变态反应、病原学及病理学等方面检查，除了解决儿科常见病，如支气管哮喘、慢性咳嗽、反复呼吸道感染等的诊断、规范化治疗和临床指导外，重点解决儿童重症疑难和罕见肺部疾病的诊治。
呼吸专业除了承担医疗工作外，还需要进行医疗教育及科学研究工作；教学工作包括本科生、全英文、8年制学生、规培生、专科规培、进修医生、研究生及呼吸道疾病高级研修班等。近5年共获得19项课题研究基金项目，包括6项国家自然科学基金，发表论文30余篇，其中SCI论文10余篇。研究主要涉及儿童肺的早期发育以及发育异常的病理基础，婴幼儿呼吸道过敏的形成机制以及早期防治。
专科特色难治性重症支原体肺炎及闭塞性支气管炎(单侧透明肺)的早期诊断与治疗
重症腺病毒肺炎及闭塞性细支气管炎防治婴儿吸入性肺炎的诊断与临床处理新生儿支气管肺发育不良的随访治疗肺出血的鉴别诊断及特发性肺含铁血黄素沉积症的诊治弥漫性间质性肺病的基因诊断与生育指导弥漫性小气道分泌物潴积类疾病的诊断(弥漫性泛细支气管炎、肺囊性纤维化及纤毛不动综合征)的诊断与处理
纤维支气管镜及介入技术：包括三级及四级支气管镜技术，可以进行气道狭窄的球囊扩张、取异物、活检、冷冻或激光技术等
CT引导下经皮肺穿刺与胸腔镜下肺组织活检技术同位素唾液吸入技术与吸入性肺炎诊断疑难肺部疾病的基因诊断技术弥漫性肺出血病因分析与介入治疗高速显微镜检查技术鼻部及支气管纤毛的电镜检查技术鼻部NO检测技术汗液氯离子检测技术
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