肠道厌氧菌的感染，根据病情的严重性采取不同的治疗措施。也可以改变日常的习惯，如调整饮食、锻炼身体，来逐渐调整恢复。对于病情较轻，可以通过自身免疫系统调理。而感染严重者，则需要通过抗厌氧菌的药物治疗。

正常肠道当中会有一些厌氧菌，这些菌是正常菌种的主要组成部分，但也可以引起人体组织的感染。而引起肠道感染的厌氧菌主要为梭状芽孢杆菌，通常使用青霉素和甲硝唑进行联合治疗。也可以调整饮食习惯和生活作息来调整肠道菌群，避免引起代谢紊乱。
　　1、疾病检查
　　通过血象，大部分患者的白细胞计数会升高，可达到60×109g/L，且中性粒细胞增加。
　　通过组织培养，可检测出粪便当中的细胞B毒素低至10pg。
　　通过大便涂片检查可见白细胞，革兰染色可看到大量阳性杆菌，采用CCFA培养基在可以在85%患者的粪便中分离出难以分辨的梭状芽孢杆菌。
　　2、诊断鉴别
　　对于服用抗菌药物后出现临床表现者即可考虑是否患上肠道厌氧菌感染，特别是针对老年人。对于加服万古霉素治疗后病情有所好转，则有助于该病的诊断，对于轻型病患者，最好的诊断方法为结肠镜检查，通过仔细观察各个部位粘膜，隆起的黄色小斑块易碎，并可能被充血、粪渣、粘液所掩盖、毒素检测对该病判断有重要的参考价值。
　　3、治疗方法
　　初步诊断为该病后应立即停用抗菌药物，因为抗菌药物可能会使梭状芽孢杆菌异常增殖，如果病情需要则应用很少诱发该病的抗菌药物。轻型病例停用抗菌药物后可以凭借自身免疫系统达到自愈。病情较严重，如大便中有假膜者则可以用万古霉素。甲硝唑适用于万古霉素治疗后的复发病例，可以根据医师指导服用，疗程通常为7-10天。
　　日常饮食方面可以适当减少食用富含纤维素成分的食物，如韭菜、蒜苔等，且少食用多渣食物，多食用易消化、软、温食物，如小米粥等。
　　上述就是肠道厌氧菌感染怎么治的一些介绍，患者可以根据患病程度，选择不同的治疗方法。而且随着厌氧菌感染的报道增多，该病也日益受到重视，治疗的手段也越来越完善。