这种病通常来说主要来自于动物宿主,故为人畜共患的自然疫源性疾病。蚊虫、鸟类、蝙蝠、家畜均可
感染。蚊虫可携带
病毒过冬,并经卵传代,为重要储存宿主。由于猪的感染率极高(仔猪在流行季中感染率可接近100%),病毒载量大,病毒血症持续时间长,猪的饲养面广,故为主要传染源。乙型脑炎病毒在猪间传染常早于人间传染1~2个月,故监测猪的感染率有助于预测人群的流行趋势。人感染乙型脑炎病毒后病毒载量少,病毒血症持续时间短,故感染者不是主要传染源。当人体被带乙脑病毒的蚊虫叮咬后,病毒经
皮肤毛细血管或淋巴管至单核巨噬细胞系统进行繁殖,达到一定程度后即侵入血循环,造成病毒血症,并侵入血管内膜及各靶器官,如中枢神经系统、肝、心、肺、肾等,引起全身性病变。