心脏外科是鲁西南地区心脏外科疾病治疗中心，科室拥有专业技术人员14人，其中山东省十佳医师1人，济宁市名医2人，硕士生导师2人、博士1人、硕士10人。上个世纪80年代初期开始开展体外循环心内直视手术，是山东省最早开展此类手术的市级医院。于2000年率先在鲁西南地区开展非体外循环下冠状动脉搭桥术手术，至今已成功完成手术1500例。于2006年率先开展心脏病合并心房颤动的术中心内膜、心外膜的射频消融治疗术，并取得了良好的疗效。
业务范围在手术治疗各类先天性心脏病、后天性心脏病得到有效治疗的基础上，大力开展非体外循环下冠状动脉内膜剥脱联合冠状动脉搭桥术，升主动脉全弓及半弓置换治疗主动脉A型夹层，联合瓣膜置换联合冠状动脉搭桥及房颤消融术治疗复杂心脏病，全胸腔镜下二尖瓣置换术等微创手术。尤其非体外循环下不停跳冠脉搭桥术成为该科近年来发展最为迅速、成绩显著的特色专业技术。
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