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病毒性结膜炎的治疗药物通常不包括抗生素类药物。病毒性结膜炎主要由腺病毒、单纯疱疹病毒等引起，治疗药物主要有更昔洛韦滴眼液、阿昔洛韦滴眼液、重组人干扰素α1b滴眼液、利巴韦林滴眼液、羟苄唑滴眼液等抗病毒药物。抗生素类药物如氯霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等对病毒无效，仅适用于细菌性结膜炎。
抗生素类药物如氯霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等，主要用于治疗细菌性结膜炎。病毒性结膜炎由病毒感染引起，抗生素无法杀灭病毒，滥用可能导致耐药性。若合并细菌感染，需在医生指导下联合使用抗生素。
糖皮质激素类药物如氟米龙滴眼液、地塞米松滴眼液等，虽可缓解炎症反应，但可能抑制局部免疫力，加重病毒感染。病毒性结膜炎急性期禁用单用激素，需严格遵医嘱与抗病毒药物联用。
抗过敏药物如色甘酸钠滴眼液、奥洛他定滴眼液等，适用于过敏性结膜炎。病毒性结膜炎以充血、分泌物增多为主，与过敏机制无关，使用抗过敏药物无法改善症状。
人工泪液如玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等，仅能缓解干眼症状。病毒性结膜炎需针对病原体治疗，人工泪液可作为辅助用药，但无法替代抗病毒药物。
部分中药滴眼液如鱼腥草滴眼液、熊胆滴眼液等，虽有清热解毒作用，但抗病毒效果不明确。病毒性结膜炎应首选明确抗病毒作用的西药，中药可作为辅助治疗。
病毒性结膜炎具有传染性，患者需避免揉眼，单独使用毛巾、枕头等物品。饮食宜清淡，多补充维生素A、维生素C，如胡萝卜、西蓝花等。急性期可用冷敷缓解肿胀，避免佩戴隐形眼镜。若出现视力下降、剧烈疼痛需及时复诊。
