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支原体或衣原体感染检测阴性可能由标本采集不当、检测方法局限、窗口期影响、病原体变异等原因引起，可通过核酸扩增检测、血清学检查、培养法、重复检测等方式进一步排查。
咽拭子或尿液中病原体载量不足可能导致假阴性，需规范采集下呼吸道分泌物或宫颈分泌物等靶标本，同时避免抗生素使用后采样。
快速抗原检测灵敏度较低，建议采用荧光定量核酸检测。支原体培养需特殊培养基且周期长达2周，衣原体需细胞培养技术。
感染初期抗体未产生或核酸未达检出阈值，建议间隔2-4周复查。肺炎支原体IgM抗体通常在发病7天后阳性率显著升高。
部分衣原体存在基因缺失突变可能导致PCR引物失效，需采用多位点检测。支原体P1蛋白变异可能影响血清学检测准确性。
出现持续咳嗽、泌尿生殖道分泌物等症状时，建议到呼吸科或妇产科就诊，配合医生完善分子生物学检查与药敏试验，期间避免无医嘱使用抗生素。
衣原体感染具有传染性，主要通过性接触传播、母婴垂直传播、间接接触传播、呼吸道飞沫传播等途径感染。
沙眼衣原体或肺炎衣原体可通过无保护性行为传播，建议感染者及伴侣同步治疗，避免共用毛巾等个人物品。
孕妇感染可能导致新生儿结膜炎或肺炎，分娩前需完成规范抗生素治疗，新生儿出生后需进行预防性滴眼。
接触被污染的浴巾、泳池等可能感染沙眼衣原体，公共场所应注意消毒，感染者衣物需单独高温清洗。
肺炎衣原体可通过飞沫传播，在人群密集场所需佩戴口罩，感染者咳嗽时应遮挡口鼻。
确诊衣原体感染后应避免亲密接触，治疗期间禁止性行为，家庭成员需分用餐具并加强环境消毒，完成抗生素疗程后需复查确认病原体清除。
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