巧克力囊肿的危害性主要取决于囊肿大小、位置及是否引发并发症，可能造成痛经加重、不孕或卵巢功能损伤。

巧克力囊肿即子宫内膜异位囊肿，囊肿较小且未破裂时，可能仅表现为轻度痛经或无症状。随着囊肿增大，经期疼痛可能逐渐加重，甚至扩散至腰骶部或大腿内侧。囊肿压迫周围组织可能导致排尿频繁、排便不适，若粘连输卵管或卵巢皮质，可能干扰卵子排出或受精卵运输，增加不孕概率。囊肿破裂时，囊内陈旧性血液流入盆腔可引发剧烈腹痛、发热或感染，需紧急处理。

囊肿长期存在可能破坏正常卵巢组织，导致卵泡储备减少或卵巢早衰。部分患者可能出现性交疼痛、非经期盆腔隐痛等症状。囊肿恶变概率较低，但若短期内迅速增大或肿瘤标志物异常升高，需警惕特殊病理类型。

建议定期进行妇科超声和肿瘤标志物检查，囊肿直径超过4厘米或合并不孕、严重疼痛时，可考虑腹腔镜手术剥除。术后遵医嘱使用地诺孕素片、屈螺酮炔雌醇片等药物预防复发，避免过度劳累及经期剧烈运动。日常保持低脂高纤维饮食，适量补充维生素D和钙质有助于调节内分泌。

巧克力囊肿可能会导致月经推迟。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现，当异位的子宫内膜组织在卵巢内生长并周期性出血时，可能影响卵巢功能，进而导致月经周期紊乱。

巧克力囊肿对月经的影响主要与囊肿大小和位置有关。较小的囊肿可能不会明显干扰卵巢功能，月经周期可保持相对规律。随着囊肿增大，可能压迫正常卵巢组织，影响卵泡发育和排卵过程，导致月经推迟或无排卵性月经。部分患者还会伴随经量增多、经期延长或痛经加重。囊肿引起的盆腔粘连也可能干扰子宫收缩，进一步加重月经异常。

少数情况下，巧克力囊肿可能合并黄体功能不足，使黄体期缩短，表现为月经提前而非推迟。极少数双侧卵巢巧克力囊肿患者可能出现卵巢功能早衰，表现为长期闭经。巧克力囊肿破裂引起的急性盆腔炎症反应，也可能导致月经周期暂时性紊乱。

建议出现月经推迟伴随进行性痛经、性交痛或不孕的患者及时就医，通过妇科检查、超声或血清CA125检测明确诊断。确诊后可遵医嘱使用地诺孕素片、孕三烯酮胶囊等药物抑制内膜生长，或考虑腹腔镜囊肿剥除术。日常应避免经期剧烈运动，保持规律作息有助于调节内分泌。