病态窦房结综合征的临床表现轻重不一，可呈间歇发作。多以心率缓慢所致的心、脑、肾等脏器供血不足引起的症状，尤其是脑供血不足引起的症状为主。轻者可出现乏力、头昏、眼花、失眠、记忆力差、反应迟钝或易激动等，常易被误诊为神经官能症，特别是老年人还易被误诊为脑卒中或衰老综合征。严重者可引起短暂黑蒙、先兆晕厥、晕厥或阿斯综合征发作。部分患者合并短阵室上性快速性心律失常发作，又称慢_快综合征。当快速性心律失常发作时，心率可突然加速达100次/分以上，持续时间长短不一，而当心动过速突然中止后可有心脏暂停伴或不伴晕厥发作。严重心动过缓或心动过速除引起心悸外，还可加重原有的心脏病症状，引起心力衰竭或心绞痛。除此，心排出量过低时还严重影响肾脏等的灌注而导致尿少、消化不良。慢_快综合征还可能导致血管栓塞症状。
