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生殖器疱疹与艾滋病是两种不同的性传播疾病，主要区别在于病原体、症状表现、传播途径和治疗方法。生殖器疱疹由单纯疱疹病毒引起，艾滋病由人类免疫缺陷病毒引起。
1、病原体不同生殖器疱疹由单纯疱疹病毒2型感染引起，艾滋病由人类免疫缺陷病毒感染引起。两种病毒属于不同病毒科，感染后对人体免疫系统的损害程度不同。
2、症状表现不同生殖器疱疹主要表现为生殖器部位出现水疱、溃疡，伴有疼痛或瘙痒；艾滋病早期可能出现类似流感的症状，后期主要表现为免疫系统受损引发的各种机会性感染。
3、传播途径不同生殖器疱疹主要通过性接触传播，艾滋病除性接触外还可通过血液传播和母婴传播。艾滋病病毒在体外存活时间较短，生殖器疱疹病毒在体外存活时间相对较长。
4、治疗方法不同生殖器疱疹可通过抗病毒药物控制症状，目前无法根治；艾滋病可通过抗逆转录病毒治疗控制病情发展，需要终身服药。两种疾病的治疗方案和预后存在明显差异。
保持安全性行为、避免多个性伴侣、正确使用安全套可有效预防两种疾病传播，出现可疑症状应及时就医检查。
